题目：Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-seq reveals tissue architecture in pancreatic ductal adenocarcinomas
期刊：Nat Biotechnol
年份：2020
本文对胰腺导管腺癌PDAC样本进行了空间转录组和scRNA-seq测序，通过无偏向性联合分析成功将scRNA-seq的细胞群结果和空间信息结果起来，进行空间定位。并发现导管细胞，巨噬细胞，树突状细胞和癌细胞的亚群具有空间受限的富集，以及与其他细胞类型的共富集。此外，分析确定了表达压力反应基因模块的炎症成纤维细胞和癌细胞的共定位。最后通过分析确认，这一无偏分析的MIA方法可以应用于揭示复杂组织固有的相互作用。
图1:单细胞测序结果展示
图2：空间转录组（ST）结果展示
图3：空间转录组亚群内不同细胞类群的比较
图4：癌细胞状态与其他细胞亚群关系图
