木本棉和草本棉的祖先为现代栽培种异源四倍体棉花提供了 A 套染色体。本文通过几种技术更新了木本棉的基因组组装。作者对 243 个木本棉和草本棉进行了重测序分析，构建了一张基因组变异图谱，发现这两个棉花与二倍体雷蒙德棉的遗传分化一致。进一步分析显示中国的木本棉源自于中国南方，而后被引种到长江和黄河流域。大多数的品种驯化性状都经历了地理隔离。全基因组关联分析鉴定了 98 个峰值与 11 个木棉重要农艺性状相关。 GaKASIII 基因上一个半胱氨酸向精氨酸的非同义突变可能导致了棉花种子中大量脂肪酸的产生。而对于枯萎病的抗性与 GaGSTF9 基因表达的激活相关。本文的研究对于进一步理解和探索棉花的 A 套染色体具有重要的意义。
棉花群体进化和 LD 分析
棉花群体选择性消除分析和 GWAS 分析
