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Illumina MiSeq

最短的时间内获得答案,智能化的工作流程,广泛的测序应用范围

Illumina公司推出MiSeq是一台在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪,每次运行能产生超过1Gb的数据,且占地面积仅为2平方英尺。MiSeq有着革命性的流程和无可比拟的准确性,这让它成为快速且经济高效的遗传分析的理想平台,适合广泛的应用。同时Illumina的最新消息,其已被FDA大量采购并即将通过FDA认证,12年10月,MiSeq系统的测序通量已升级至8G左右。升级通过两个方面完成,一个是cluster密度的增大,升级后cluster密度增加至15-17million,而pair-end读取的reads数目将会增加至30-34million;另一方面是通过测序读长而提升通量,测序读长达到2*300bp,同时测序速度也有所提升。目前,Broad研究院已经利用现有试剂实现了单端测序300bp读长,Illumina目前内部测序更是完成了2*400bp的pair-end测序。而这些,都是保证在高质量数据结果的前提下完成的。


MiSeq性能参数


测序时间和数据量


读长(bp)时间总数据量Q30
1×36~4 hrs540-610 Mb﹥90%
2×25~5.5 hrs750-850 Mb﹥90%
2×100~16.5 hrs3.0-3.4 Gb﹥85%
2×150~24 hrs4.5-5.1 Gb﹥80%
2×250~39 hrs7.5-8.5 Gb﹥70%



读取量比对


运行类型通过过滤的读取(百万)
升级前升级后
单端读取5-7 M15-17 M
末端配对读取10-14 M30-34 M


 

工作流程


 

 

大特性

1、超短的实验周期:从样品制备开始只需要8小时即可得到超过100M的高质量测序结果。

2、便捷的样品制备流程:只需50ngDNA模板,2小时的自动化操作就可以完成全部样品制备工作。

3、精确的测序原理:MiSeq继续GA和HiSeq平台的边合成边测序的化学原理,数千篇高质量的国际期刊文章是对Illumina NGS平台测序结果可信度的有力证明。

4、完整的整合功能:MiSeq可以独立完成簇生成,双向测序及数据分析工作,让经费和实验室空间不再成为NGS研究的障碍。


 

应用范围

1、转录组测序

派森诺MiSeq测序平台是基因组已测序物种的转录组分析最佳平台。公司技术团队目前已完成了包括斑马鱼在内的多种植物、动物的转录组测序及分析。


2、宏基因组16S rDNA单V区测序

对16s rDNA的单V区(V3\V4)进行高通量测序,鉴定细菌群和古生菌群。派森诺的技术团队使用Illumina MiSeq测序16S rDNA V4区并结合Roche 454 FLX+测序16S rDNA V1~V3区成功的对鸡的肠道环境细菌进行了鉴定。


3、Small RNA测序

1*35bp的读长完美地配合了小RNA的测序长度,速度快,灵敏度高。派森诺的技术团队目前已完成了鹅的小RNA测序和多种中草药的小RNA测序。


4、重测序:包括全基因组重测序、简化基因组测序、外显子测序。

Illumina MiSeq非常适用于对微生物基因组的重测序,每次运行即可完成一个微生物基因组测序。2011年12月27日,派森诺的技术团队利用MiSeq一次运行同时完成了乳酸菌(Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8)的重测序,基因组覆盖深度为分别为404倍和213倍,比对至参考序列,基因组覆盖率为100%,同时检测到了多种结构变异,包括插入、缺失和SNP位点,并且检测到了全部质粒。

 


数据展示