微生物多样性,派森诺生物与南京农业大学再次合作: 发表香蕉树根际微生物群落研究文章

派森诺生物与南京农业大学再次合作: 发表香蕉树根际微生物群落研究文章

 
   简介   

 
      派森诺生物与南京农业大学李荣教授领衔的团队携手合作,应用高通量测序的方法及宏基因组分析手段对连续2年施用抑制香蕉枯萎病的生物肥料的香蕉树根际土壤中微生物群落的变化情况进行了剖析。让我们一起来目睹一下香蕉树根的微生物多样性是怎么样的吧!

本篇文章用Roche 454焦磷酸测序研究了生物肥料(BIO),猪粪堆肥(PM),和化学肥料(CF)对根际细菌和真菌群落的影响,并探索微生物群落组成和香蕉枯萎病的潜在关系。研究成果《Rhizosphere microbial community manipulated by 2 years of consecutive biofertilizer application associated with banana Fusarium wilt disease suppression》发表在Biol Fertil Soils


  实验目的  

研究生物肥料(BIO),猪粪堆肥(PM),和化学肥料(CF)对根际微生物群落的影响,并探索微生物群落组成和香蕉枯萎病的潜在关系。


  研究对象  

细菌和真菌。


  实验方法  

对三种肥料处理研究人员分别收集了相距5m以上的5棵香蕉树的根际土并混合。对每棵树从树干基部0-20cm的深度随机取样,从中心获取根段并合在一起,根段上的土用手轻抖下来,之后根被切成约5cm的小段,放入装有250ml灭菌水的1L的锥形瓶中摇动30min,4000×g离心10min收集沉淀得到根际土用于提取DNA。


  测序平台  

Roche 454 FLX+。


  测序区域  

16s V4-V5区和ITS 。


  实验结果  

    1.    Acidobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, ProteobacteriaAscomycota是所有样品中丰度最高的细菌和真菌的门。

    2. 与PM和CF对照相比,连续两年施用BIO后,细菌门的多样性显著增加,而真菌多样性显著降低。

    3. BIO处理组,Acidobacteria,Firmicutes, Leptosphaeria和Phaeosphaeriopsis 显著增多,而Proteobacteria 和Ascomycota 显著减少。

    4. BIO 处理中Fusarium(香蕉枯萎病的致病病原体)的丰度与CF相比显著降低,与PM相比略有下降 。

    5. 香蕉枯萎病的发生率与Acidobacteria (Gp1 and Gp3),Firmicutes, Leptosphaeria和 Phaeosphaeriopsis这些类群的丰度负相关,但是与Proteobacteria, Ascomycota, Fusarium, Cylindrocarpon, Gymnascella, Monographella, Pochonia和Sakaguchia类群的丰度正相关。

 
  实验结论  

连续两年施用生物肥料影响根际微生物组成,通过增加细菌多样性和促进Acidobacteria (Gp1 and Gp3), Firmicutes, Leptosphaeria和Phaeosphaeriopsis 等的含量抑制Fusarium(香蕉枯萎病的致病病原体)的种群含量。


  部分结果展示  

森诺生物与南京农业大学再次合作: 发表香蕉树根际微生物群落结果分析图

森诺生物与南京农业大学再次合作: 发表香蕉树根际微生物群落结果分析图

森诺生物与南京农业大学再次合作: 发表香蕉树根际微生物群落结果分析图

森诺生物与南京农业大学再次合作: 发表香蕉树根际微生物群落结果分析图