2017-05-08
梨是我们日常生活中最常见的水果之一，而且广泛分布世界各地。梨最早起源于中国西部山区，而古罗马人为梨的栽培与传播做出了重要贡献。据报道，梨的栽培已有2000~3000年的历史，公元前1世纪就有40多种梨的栽培品种。目前在50多个国家都有梨的栽种，几乎遍布各个大陆。之所以能有如此广泛的分布，在于能够培育出适应各地不同环境的品种。尽管有着广泛的地理分布，但并没有出现明显的生殖隔离，这对新品种的繁育有着重要意义。
说到遗传育种，就不得不提分子标记。分子标记在遗传多样性和遗传关联分析等研究领域有着重要应用。接下来小编为大家介绍一篇利用GBS（Genotyping-by-sequencing）技术对梨的遗传多样性及选择印记进行研究的报道。
材料和方法
研究者选用来自亚洲品种、欧洲品种以及两者杂交品种的214个个体作为研究材料。并对其相关性状（果实硬度、大小、酸度及变形等）进行调查。通过GBS的方法对样本进行测序。以P. × bretschneideri (cultivar ‘Suli’) 和P. communis(cultivar ‘Bartlett’)为参考基因组，对不同样本进行变异检测。
结果与讨论
1.从GBS数据中获得15000个高质量SNP 标记位点。其中欧洲种和亚洲种分别含有25%和11%的独有等位基因。
2.通过NJ法构建无根进化树，发现欧洲种和亚洲种之间存在明显的群体分离现象。
3.通过群体结构分析，发现种间杂交物种有55%的遗传物质来自亚洲祖先，45%的遗传物质来自欧洲祖先。
4.不同样本间的表型变异与遗传分化有着显著的关联性。通过大数据量的选择扫描分析确认了20多个离群SNP位点，这些位点可能是受到定向选择或者跟选择相关的位点。
总结
本文对选择区域查找和基因型-表型联合分析在生物适应和选择印记研究中的应用进行了初步探讨。该研究对于欧洲和亚洲梨的独立进化的理解以及对于梨的适应性研究有着重要的意义。
