病毒(Virus)由一种核酸分子(DNA或RNA)与蛋白质(Protein)构成或由蛋白质构成(如 朊病毒)。根据遗传物质的组成,可分为单链 DNA 病毒(ssDNA)、双链 DNA 病毒(dsDNA)、单链 RNA 病毒(ssRNA)、双链 RNA 病毒(dsRNA)和蛋白质病毒(如朊病毒)。根据宿主类型的不同,可以分为噬菌体(细菌病毒)、植物病毒(烟草花叶病毒)和动物病毒(如禽流感病毒、天花病毒和HIV等)。
病毒全基因组测序(Virus Whole Genome Sequencing,VWGS),是指基于二代高通量测序技术,对病毒全基因组进行测序,利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因组序列,解析编码信息,并获得相应的变异信息。
产品参数
产 品 | 文库插入片段大小(bp) | 测序平台及测序模式 | 测序深度 | 交付指标 | 项目周期 |
1 痕量单链RNA病毒测序 A | 300 ~ 500 | Illumina MiSeq,PE251 | ~100 × | 数据量 | 30 个自然日 |
痕量单链RNA病毒测序 B | 300 ~ 500 | Illumina HiSeq,PE150 | ~100 × | 数据量 | 40 个自然日 |
常规单链RNA病毒测序 A | 300 ~ 500 | Illumina MiSeq,PE251 | ~100 × | 数据量 | 30 个自然日 |
常规单链RNA病毒测序 B | 300 ~ 500 | Illumina HiSeq,PE150 | ~100 × | 数据量 | 40 个自然日 |
常规双链DNA病毒测序 A | 300 ~ 500 | Illumina MiSeq,PE251 | ~100 × | 数据量 | 30 个自然日 |
常规双链DNA病毒测序 B | 300 ~ 500 | Illumina HiSeq,PE150 | ~100 × | 数据量 | 40 个自然日 |
* 测序深度:推荐的测序深度指目标病毒基因组的测序深度,具体测序数据量计算参见“病毒基因组测序数据量估算”;
1 痕量病毒:指核酸量在10 ng~200 ng的病毒样品
样品要求
*病毒类样本不接受原样送样,只接收核算样品,及DNA病毒仅接受提取好的双链DNA,RNA病毒仅接受反转录好的双链cDNA。