利用高通量测序技术对某一物种或群体的基因组进行测序,通过与参考基因组进行比较,获得该物种或群体在全基因组范围内的遗传变异信息(SNP、InDel、SV、CNV)等,建立遗传多态性数据库,为后续揭示进化关系、功能基因挖掘等研究奠定基础。
基于重测序 | 基于简化 | |
测序平台及模式 | Illumina HiSeq,PE150 | |
测序深度 | SNP、InDel(≥10X),SV(≥20X)、CNV(≥30X) | 混合建库;Tag数≥10万,平均8x / Tag |
项目周期 | 标准分析40天 | 标准分析40天 |
DNA样本量 | 总量≥0.5 μg,浓度≥10ng/μl(单个样本) | 总量≥0.5 μg,浓度≥10ng/μl(总样本) |
参考基因组 | 必须有参 |