CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,是新一代超微量ChIP-Seq技术,适用于无ChIP级别抗体的蛋白研究。与传统的ChIP-Seq研究方法相比,该技术无需交联、超声打断、末端抹平和接头连接等操作,因此具有省时高效、所需的样品量少、背景信号低和可重复性好等优点,甚至可用于单细胞水平测序。CUT&Tag有望将蛋白质-DNA互作的研究变成一种类似PCR反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有革命性的意义。
技术原理:CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)技术,该技术利用一抗靶向结合目的蛋白,二抗孵育放大信号,创新性的pA-Tn5融合蛋白与一抗和二抗中的Fc区结合,Mg2+激活pA-Tn5的Tn5酶活性后切割目标区域并加上接头,经PCR扩增就可获得目标蛋白结合区域的文库。简化建库操作,提高了信噪比,实现了低细胞量样本研究组蛋白修饰和转录因子的目标。
推荐平台:Novaseq 6000 PE150
生物信息分析
1.原始数据整理、过滤及质量评估
2.与参考基因组序列比对
3.Peak Calling(统计每个样品的Peak片段信息)
4.基因附近及Peak中心信号分布图
5.Peak序列Motif及注释分析
6.Peak邻近基因功能分析
7.差异Peak序列Motif及注释分析
8.差异Peak邻近基因功能分析
9.Overlap基因功能分析
派森诺的优势
1.根据实际需求可个性化定制测序及分析方案。
2.严谨的实验流程和检测结果,数据分析结果可信。
3.分析结果的图表参考国际期刊设计,可直接用于文章写作。
4.与转录组等数据进行联合分析,挖掘生物信息资源。