基因组从头测序（de novo sequencing），主要针对基因组序列未知或参考基因组组装不理想的物种，构建不同类型的基因组DNA文库，并进行序列测定。然后使用生物信息学方法对序列进行拼接、组装和注释，从而绘制该物种完整的基因组序列信息。简单基因组：重复序列低于50%，且二倍体杂合度低于0.5%的物种。
复杂基因组：重复序列高于50%，或二倍体杂合度高于0.5%，或其他多倍体物种。
产品参数
测序方案 | 测序策略 | 交付指标 | 项目周期 | |
简单基因组 | 纯三代 | 文库：20Kb 三代（80X）+10XGenomics/Bionano/ Hi-C | Contig N50≥ 1Mb | （二代）40个自然日（标准分析）； （二代+三代+Hic）75个自然日（测序+组装+注释） |
3+2混合拼接 | 三代（40X）+二代（PE, 100X） | Contig N50≥ 500Kb | ||
复杂基因组 | 纯三代 | 文库：20Kb 三代（100X）+10XGenomics/Bionano/ Hi-C | 视物种而定 | |
3+2混合拼接 | 三代（40X）+二代（PE, 100X） | Contig N50≥ 200Kb | ||
哺乳动物和鸟类 | 纯三代 | 文库：20Kb 三代（80X） | Contig N50≥ 3Mb | |
3+2混合拼接 | 三代（40X）+二代（PE, 100X） | Contig N50≥ 1Mb |
