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科研服务

宏基因组测序

宏基因组测序研究

宏基因组学 (Metagenomics) 研究通过全基因组鸟枪法 (Whole Genome ShotgunWGS) 测序策略,将提取获得的微生物组总 DNA 随机打断为短片段,并构建合适长度的插入片段文库,对这些文库进行双端 (Paired-endPE) 高通量测序,从而能全面精细地展示整个菌群的功能代谢谱和物种精细组成谱,进而在组成和功能水平分别挖掘关键生物标记物,从原理上阐明微生物群落在生态系统中发挥作用的根本机制。


产品特点

1. 直接对菌群样本中的基因片段进行测序,真实再现菌群复杂而精密的生态功能;

2. 使用Illumina HiSeq系列超高通量测序平台,周期更短,每个样本都能一次性获得至少10 Gb的测序数据量,真正实现对物种和功能的精确定量;

3. 多种功能注释数据库可选,根据研究需求选择KEGG/EggNOG/CAZy/NR/Swiss-Prot/GO/VFDB/CARD等数据库,最优化宏基因组功能代谢谱注释;

4. 通过微生物基因信息精确识别物种来源,获取种以及种以下水平的“高分辨率”物种精细组成谱;

5. 通过多种多变量统计分析和机器学习方法,系统、深入地挖掘宏基因组大数据中差异相关的关键物种和关键功能,精确识别关键生物标记物。


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