全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)是一种在某一特定群体中研究遗传突变和表型之间的相关性的方法。通过对遗传多样性丰富的自然群体中的个体进行测序,结合准确的目标性状的表型数据及统计方法进行全基因组分子标记与性状之间的关联分析,可对动植物复杂性状进行定位,快速获得影响目标性状表型变异的遗传标记或候选基因。
产品参数
基于重测序 | 基于简化测序 | |
测序平台 | Illumina Novaseq | |
打断方式 | 物理打断 | 双酶切打断,片段220-450bp |
测序深度 | ≥5×/样本 | ≥2×/样本 |
文库类型 | PE 300~500bp(推荐) | dd-RAD文库 |
样本选择 | 无明显亚群分化的自然群体,个体数不少于200个 | |
DNA样本量 | 总量≥0.5 μg,浓度≥10 ng/μl (单个样本) | 总量≥0.5 μg,浓度≥10 ng/μl (总样本) |
适用范围 | 有参考基因组物种 | 参考基因组较大的物种 |
项目周期 | 标准分析40天 |