菌群组成谱全长测序研究
基于PacBio三代测序平台,能够读取群落微生态系统中微生物的rRNA基因/ITS全长序列,不受制于短序列的局限性,并确保全长序列的测序,从而在种甚至菌株等精细水平,解析菌群多样性和组成谱。
产品特色
l 深入获取微生物群落的精细组成信息;
l 预测微生物群落的潜在代谢功能,并指导后续宏基因组测序研究;
l 通过“全微生物组关联研究(Microbiome-Wide Association Studies,MWAS)”,鉴定与表型/组间差异相关的关键物种。
应用领域
l 微生物组与环境互作关系的研究;
l 微生物组与宿主共生关系的研究;
l 微生物组在临床医学和精准医疗领域的应用;
l 微生物组在发酵工艺、食品加工/检测等行业的应用。
派森诺优势
l 自动化、完善的DNA提取扩增体系和样本前处理流程;
l 派森诺拥有PacBio RSII和Sequel两种单分子实时测序平台,提供测序服务;
l Greengenes/Silva/HOMD/RDP/Unite/MaarjAM等多个物种注释数据库,优化物种的分类鉴定;
l 专家教授多方位支持,可按需个性化定制;
l 项目经验丰富,涵盖水样、活性污泥、土壤、排泄物、体液、组织等各类样本。
PacBio和Illumina平台对菌群16S rRNA基因测序结果的比较,并改善物种分类信息的不确定性。
派森诺菌群组成谱全长测序分析流程