2024-04-07
派森诺基因云,新推出的转录组2.0分析系统,在原有系统上实现重大升级:首先,优化了一键式分析流程,升级为数据集创建形式,简化操作,提高效率,且新增数据集管理功能;其次,积极响应用户需求,添加了样本重命名功能,增强数据管理的灵活性;此外,还强化了数据筛选过滤功能,支持按多维度精确筛选转录组数据,提升转录组数据分析的便捷性和准确性。一起来看看这些强大的功能如何操作吧~ 一、数据集创建 支持自定义创建数据集,选择需要分析的章节,配置参数后一键提交分析。如果需要进一步对数据集每个章节结果进行调整,可在对应章节页面切换数据集查看修改。 二、样本重命名 新增样本重命名功能,方便用户修改和管理样本。通过切换不同的样本方案名称,快速实现样本名称的更换。
三、数据筛选 3.1、火山图的标注基因 基因标注有三种筛选方式:分区筛选、总体筛选以及自定义筛选。 1. 分区筛选 对up(上调)和down(下调),分别筛选过滤出topn的基因。 2. 总体筛选 不区分topn,整体筛选出topn的基因。 3. 自定义筛选 自定义输入感兴趣的基因ID,在图中进行标注。 3.2、聚类分析的基因标注 标签内容可选择任意一种显示:基因名称、基因ID、数据库名称、以及自定义标签名称。 3.3、GO富集分析的Go term筛选 Go term筛选也有三种方式进行选择:全部、分组、以及自定义。 全部:根据P值或adjustPvalue过滤排序后,选择topn的Go term在图表中显示。 分组:分别对BP、MF、CC取topn的Go term进行展示。 自定义:自定义输入Go term在图中进行展示。 3.4、KEGG富集分析的KEGG Pathway筛选 和go富集分析一样,也提供3种KEGG Pathway筛选方式,分别是全部、level、以及自定义。
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