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微生物-器官轴 | 多组学探究妇科癌症-宫颈癌

2024-04-15

在当今生命科学的前沿领域中,微生物器官轴的研究正逐步揭示出人体健康与疾病崭新的维度。近年来,科学家们发现,宫颈微生态失衡可能与宫颈癌的发生发展密切相关,其中的微生物群落结构变化和功能异动可能构成了宫颈癌发生的一个潜在驱动因素。

多组学研究策略为探索微生物器官轴与宫颈癌之间的内在联系提供了前所未有的深度和广度。它通过整合多种数据,勾勒出宫颈微生态全景图,进而揭示宫颈癌患者体内微生物组成和功能变化的独特模式。这一系列深入细致的研究,无疑将为我们理解和防治宫颈癌打开新的窗口,有望推动临床诊疗策略向更加精准化、个性化的方向发展,从而改善宫颈癌患者的预后并提升其生活质量。



案例一

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文章题目:Deciphering the complex interplay between microbiota, HPV, inflammation and cancer through cervicovaginal metabolic profiling

期刊:EBioMedicine

影响因子:11.1

研究背景

阴道微生物菌群失调被认为是导致 HPV 介导的宫颈癌和生殖器炎症持续存在的因素,但其机制尚不清楚。鉴于癌症是一种新陈代谢疾病,对宫颈阴道微环境进行新陈代谢分析有可能揭示宿主和微生物在 HPV 持续存在和发展为癌症过程中的功能性相互作用。

组学手段

16S rRNA、非靶代谢

技术路线

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结果展示

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研究结论

本研究通过整合阴道代谢组、微生物组和免疫蛋白组数据,揭示了宫颈癌发生过程中多个新兴癌症标志(如氮和能量代谢异常、氨基酸和碳水化合物通量改变引发的细胞增殖增加,以及菌群失调和宿主-微生物共代谢紊乱)的存在。这些发现深化了我们对病毒-宿主-微生物相互作用在宫颈癌发生中的复杂机制的理解,并为未来开发针对宫颈疾病的诊断、预防或治疗策略提供了新视角。



案例二

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文章题目:The vaginal metabolome and microbiota of cervical HPV-positive and HPV-negative women: a cross-sectional analysis

期刊:Bjog-an International Journal Of Obstetrics And Gynaecology

影响因子:5.8

研究背景

分子研究发现,与HPV表现为阴性的女性相比,HPV表现为阳性的更有可能出现以惰性乳杆菌为主导(CST III)或低乳酸杆菌molecular-BV状态。以格氏乳杆菌为主的CST II与可检测到的HPV清除率增加有关。

阴道微环境包括微生物和宿主产生的代谢物,这些代谢物可能会影响临床终点。尽管阴道代谢很大程度上是受驻留微生物群的影响,但前期研究已发现代谢物与重要的临床症状有关。然而,HPV 感染的影响仍未被探究。

组学手段

16S rRNA、非靶代谢组

技术路线

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结果展示

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研究结论

在生物胺、谷胱甘肽和脂质相关代谢物等几种代谢物方面,HPV+女性的阴道代谢组与HPV-女性有所不同。如果在未来的研究中证实还原型谷胱甘肽和氧化型谷胱甘肽水平的增加与 HPV 发病率/持续率之间存在时间上的关系,那么抗氧化疗法可被视为一种非手术的 HPV 控制干预措施。


参考文献:

1.Ilhan ZE, Łaniewski P, Thomas N, Roe DJ, Chase DM, Herbst-Kralovetz MM. Deciphering the complex interplay between microbiota, HPV, inflammation and cancer through cervicovaginal metabolic profiling. EBioMedicine. 2019;44:675-690. doi:10.1016/j.ebiom.2019.04.028

2.Borgogna JC, Shardell MD, Santori EK, Nelson TM, Rath JM, Glover ED, Ravel J, Gravitt PE, Yeoman CJ, Brotman RM. The vaginal metabolome and microbiota of cervical HPV-positive and HPV-negative women: a cross-sectional analysis. BJOG. 2020 Jan;127(2):182-192. doi: 10.1111/1471-0528.15981. Epub 2019 Nov 20. PMID: 31749298; PMCID: PMC6982399.



派森诺生物合作客户在微生物-肿瘤领域发表的部分文章

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派森诺生物作为国内早期涉足微生物多样性测序的高通量测序公司,在微生物-器官轴领域积累了丰富的项目经验。通过整合宏基因组学、微生物多样性组成谱测序、代谢组学、转录组学等多组学方法,我们建立了全面的实验平台和数据分析体系,提供从样本准备到文章发表的全方位服务。我们的多组学联合分析手段,如关联热图、网络图分析、Mantel检验和Procrustes分析等,能够深入挖掘微生物与器官轴之间的功能机制,为研究微生物-器官轴研究提供坚实的支持。