2024-05-29
在我们生活的各个角落，都隐藏着一个神秘而又庞大的微观世界，那里居住着数以亿万计的微生物。今天，跟着小派一起踏上这场探索微生物组学奥秘的旅程，从研究思路到实践应用，全面解锁微生物组学的无限可能！无论您是初步接触微生物组的小白，还是已经略有建树的研究者，这趟旅程您一定会满载而归。干货较多，记得收藏哦。 （ps：后续具体视频及软文内容点击网站或超链接查看，红色的为派森诺云学院视频，蓝色的为干货软文。视频只需注册即可观看哟）
第一站 思路大派送-微生物组学的奇幻之旅启程 欢迎小伙伴们踏入微生物组学的神秘殿堂！是否还苦恼于什么是微生物组？怎么去研究微生物组？微生物组的实验该如何设计吗？首先，我们将为大家带来一系列精彩纷呈的思路大放送。无论您是对微生物组学充满好奇的新手，还是渴望深入探索的研究者，这里都将有您想要的答案。多维度的数据融合和生动的案例解读将转化为一把把钥匙，解锁微生物与健康、环境、农业间错综复杂的关联。让我们共同踏上微生物组学的奇妙之旅！ 1、以微生物为中心的多组学整合研究 微生物组大数据挖掘思路；全微生物组关联分析MWAS；多组学整合研究的方法；多组学整合研究案例解读 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/a3acffcb565643928c072d9de25a2fd9 2、一起聊聊微生物组研究中的多组学整合思路 多组学整合思路和案例介绍 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/823b0c4fb5f94b799caeffced54034a5 3、多组学技术在中医药研究领域的应用 中医药研究领域微生物组多组学思路归纳；多组学关联的常用分析方法；案例分享 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/0858cf4089e871ee80185107e0c90102 4、微生物组在医学研究中的应用和思路 微生物和医学研究的关系；思路和分析方法；案例介绍 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/2d73d5d083b54889890acd8345095510
6、微生物组在农学研究中的应用和思路
微生物和农学研究的关系；思路和分析方法；案例介绍
https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/b8cc94c9b4574c63afe2a6e1b8f51f70
7、环境微生物组合作成果大盘点！ 8、食品 & 微生物组领域，期刊影响因子知多少？ 9、微生物组研究，多组学整合关联是王道！ 10、2023年派森诺微生物组项目文章集锦 11、【开学季献礼】派森诺微生物组合作成果大盘点！ 12、史上最强合集，微生物组合作成果大盘点！ 13、轻松入门微生物组学，看这一篇就够了！
第二站 教授开讲啦-微生物组学名家讲座 掌声有请我们的专家教授！他们将带您穿梭于微生物组学的核心领域，为我们揭示微生物组学的深层奥秘。让我们一同领略领略学术的无穷魅力，千万不要错过哦！ 1、陈廷涛教授微生物组讲座录像：健康的破坏者与重建者 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/add9cdcfbe3e459c97af256ad806cd2b 2、沈友明博士微生物组讲座录像:”守卫香甜”的苹果表面微生物初探 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/8501a9bfe590400099a77a84b4c4abb3 3、赵超教授微生物组讲座视频:从菌群组成分析到其后机制的桥梁 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/a16dffca8dfd4750b9ba336b422d324f 4、段胜仲教授微生物讲座视频：口腔-肠道微生物交流与高压的因果关系 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/cf2e56872cf64488b89f38f9bfa46d58 5、孙蔚旻教授微生物讲座视频：尾矿极端环境下的的生物地球化学过程及其环境调控 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/adc4e1671a9d49779f96b19c8655502a
第三站 结果解读-揭开微观世界的神秘面纱 在制定了研究策略并进行了微生物组分析后，面对结果数据是否仍是一头雾水？α、β多样性意味着什么？什么是关联网络？功能注释的奥秘何在？以及binning分析又是如何助力我们探索的？？接下来，我们将逐一解开这些谜团，详细阐述如何解读微生物组分析的结果，帮助您深入理解微生物群落的组成、结构和功能分析等。并通过知识进阶和拓展，让您从小白进阶到大牛！跟着小派继续踏上这场充满惊奇的微生物探索之旅吧！ 菌群多样性组成谱 总体结果解读 1、包含两个视频： ①基于QIME2平台的全新分析流程及基因云分析平台简介 什么是QIME2及完整详细多样性报告解读（基于云分析界面）。 ②从组成到功能：微生物组功能分析的意义和方法 为什么要预测群落代谢功能；PICRUSt2功能预测简介（改进、分析流程、不同功能预测的方法）。 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/2c3eb874e3af4a63bd5a966feb6f7691 2、一起来聊聊：QIIME2云分析的应用和拓展 QIIME2云分析简介（流程概述、基因云简介）；重点分析内容剖析（基于PPT讲解完整多样性结果）；文献分享；云分析实操（10分钟快速介绍所有内容） https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/5852089e6b434dc99b217a8f62bf4da8 3、结题报告生成演示 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/4b559225f1144969b4d36083b60966e7 4、分组方案创建 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/75221e51e0c6492a86450b2d68598391 分章结果解读（PPT+云分析实操） 6、微生物组云分析实操和数据挖掘1：序列处理与物种组成篇 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/6c9ddcaa7a5347b99aca50170518e421 进阶1: 一键玩转QZV，带您体验最纯正的QIIME 2！ 进阶2: 坐拥classify-sklearn和brocc两大神器，QIIME2如何搞定物种注释？ 7、微生物组云分析实操和数据挖掘2：α、β多样性分析 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/fb00c92c122d4ac886a5918c5ea13068 7.1、Alpha多样性指数介绍 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/a00144f0cd1c47a7aef8e5602e498edb 7.2、稀疏曲线 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/bdcc9340b328465c8d2cf5e400768b58 8、微生物组云分析实操和数据挖掘3：物种差异与标志物种分析 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/7267a17164ff4df18a47a222ff7d5387 9、微生物组云分析实操和数据挖掘5：关联网络分析与功能潜能预测 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/890080927b664581b636bd76402e3fe2 进阶1：关联网络云分析 网络分析的种类和方法讲解；网络分析在微生物组中的应用；基因云网络分析实操；案例解读 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/7cbcf27b5c6148a9b8bdc76baf3abda4 进阶2：功能预测云分析 PICRUSt2分析和优势；案例分享；云平台演示；其他功能预测方法（Tax4Fun、Bagbase、FarProTax、FunGuild）；会后答疑 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/e1b25fe798a54cb79de7e40c11ba6bde 进阶3: MetaCyc：一个致力于收集所有已知生命代谢通路的数据库 进阶4：KEGG功能数据库的使用 KEGG数据库详细介绍；KEGG在微生物组中的应用；KEGG数据库实操 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/bbb5d6fd1b41424e9d5b3e242c50173a 宏基因组和宏转录组 云平台结果解读 1、宏基因组和宏转录组基础分析讲解1：数据处理分析 宏基因和宏转录介绍；分析流程；基于ppt介绍结果 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/2b2617b7bdf44ab298f8842ec7ac7079 2、宏基因组和宏转录组功能分析讲解2：功能水平分析介绍 差异分析与通路映射图；富集分析；KEGG数据库使用 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/b6dfe37d04fd44ceb9f08ba72356397e 3、宏基因组云平台操作演示1：序列处理分析 宏基因组序列处理分析云平台报告解读 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/914fd6e0d28771ed80a06732b68f0102 4、宏基因组云平台操作演示2：物种水平分析 派森诺物种注释的优势；宏基因组物种水平分析云平台报告解读 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/3ce8f420d45271edb54c6733a78e0102 5、宏基因组云平台操作演示3：功能水平分析 功能注释的原理和优势；14大数据库介绍；宏基因组物种水平分析云平台报告解读 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/22deaa10ea2971ed805c6732b68e0102 6、宏基因组云平台操作演示4：数据集管理和物种功能对应分析 宏基因组数据集管理和物种功能对应分析云平台报告解读 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/ebed2760ea2971ed805c6732b68e0102 7、派森诺宏基因组“龙”重升级，20大数据库分析一次性交付！ 知识进阶 8、基于reads的宏基因组，微生物挖掘的新思路 基于reads的宏基因组原理介绍；宏基因组数据挖掘方法；案例分享 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/c0f6965a9fa471ee80590675b3ed0102 9、Binning分析讲解 Binning原理和应用；metaWRAP讲解；报告解读 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/a330417870da4050b3b658fb20052813 10、binning分析新流程，深入挖掘微生物的潜能 宏基因组binning原理和升级介绍；各领域binning研究思路；binning案例 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/90a3f5b3adc071eebfc34531859c0102 11、做宏基因组太common？宏基因Binning分析让您的文章与众不同！ 12、宏组学分析的应用和拓展 宏组学概况、分析流程介绍、分析内容介绍、案例分享 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/7ee13c583eb141dfb386464e6956a94e 13、真菌宏基因组，助力环境真菌的研究（更多聚焦真菌） 真菌宏基因组介绍；真菌宏基因组原理和流程介绍；真菌宏基因组各类领域思路；案例分享 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/50faa456adc171ee9c1e6732b78e0102
第四站 绘图教程-绘图大师的魔法棒 在微生物组学的研究中，数据可视化是不可或缺的一环。一个清晰、美观的数据图表不仅能让研究结果跃然纸上，更能助力读者轻松洞悉其深层含义，并赢得审稿人的青睐。接下来，继续我们的绘图之旅，小派手把手教您如何运用派森诺云图汇和代码，将海量数据转化为生动图片。让我们一起动手实践，让数据说话！ （140+常见组学及科研图片任您绘制，注册派森诺基因云即可乐享交互） 1、相关性分析 Spearman\pearson相关性；关联网络分析；RDA、CCA、VPA、PCoA-envfit https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/9aa1e68286674fe583a935a80c50606a 2、微生物组研究中的云图汇高频应用 基因云介绍；云图汇实操：差异检验箱线图、关联热图、RDA\CCA、韦恩图、相关系数图、PCo、关联网络 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/e75dcca543f74803a08713b4a309ad71 3、微生物组云图汇高频分析工具（最新） circos图；差异检验箱线图；多功能差异检验图；韦恩图；upset图；相关系数图；RDA\CCA；关联网络；关联热图；网络热图（mantel test） https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/535c35c0ea6271ed80446732b68f0102 4、微生物组R分析绘图实战 CCA；RDA；相关性热图讲解和实操 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/daf5897c31db44f6908204a61b40d078 5、菌群差异分析不求人，高颜值箱线图一键GET！ 6、云图汇实操讲解：RDA/CCA/PCoA_envfit分析1 7、云图汇实操讲解：RDA/CCA/PCoA_envfit分析2 8、高颜值功能单元热图轻松绘制 9、一文读懂QZV，一键玩转3D-PCoA！ 10、快速绘制物种关系Circos图，让您省时又省力 11、交互式关联热图，让绘图更加流畅丝滑~ 12、如何高效使用聚类条形图？
第五站
拓展延伸-探索微生物组的宝藏
在这一站，我们将踏上微生物组学的深入探索之旅，带您领略这一领域的广阔天地和无限可能。小派将介绍一些前沿的技术和工具，包括常见数据库介绍、孟德尔随机化的应用、微生物群落构建模型以及其他微生物组测序技术等。这些技术和工具将帮助您更深入地理解微生物组学的奥秘，为您的研究提供新的思路和方法。
1、MBPD数据库：细菌病原微生物鉴定的新工具
病原微生物检测方法概览；MBPD数据库简介和其他数据库比较；细菌病原数据库应用案例
https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/70c158b3941071ee856f6733a68f0102
2、MBPD：多种病原细菌检测流程，守护健康，科学预防！ 3、扩增子和宏基因组测序常用数据库介绍
Silva、Greengenes、UNITE、PR2、HOMD、Greengenes2、NCBI、GTDB
4、孟德尔随机化助力研究微生物与疾病的因果关系
孟德尔随机化原理和流程和结果介绍；医学微生物研究现状；孟德尔随机化+微生物的案例
https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/30584a439fa571ee801f0764b3ec0102
6、微生物群落构建模型，环境微生物领域研究高分利器
环境微生物组研究介绍；微生物群落多样性介绍；群落构建模型（NCM、βNTI、iCAMP、NST）解析多样性机制介绍；研究案例
https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/2301f4008e8171ee87880764a0ec0102
7、群落构建模型NCM、βNTI、iCAMP...傻傻分不清楚？一文让您了解！！！ 8、Pacbio测序之全长16S测序 9、解决微生物定量难题！派森诺带您了解16S绝对定量扩增子测序技术 10、解读RDA和CCA的基础原理及应用
第六站 干货满满-微生物组学秘籍大放送 经过一系列的探索和挑战，我们终于抵达了终点站，想必您在前面的旅程中已经积累了丰富的数据和精美的图表。现在，是时候将这些宝贵的成果转化为文字，给大家展示您的研究成果了。没有思路？不知道怎么应用数据？别担心，小派最后为您准备了一系列实用的秘籍和技巧，助您在科研道路上更加从容自信。 1、微生物组学术论文撰写方法与经典案例解读 论文该怎么写；微生物组论文撰写思路；微生物组常用图表解读；案例分享 https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/subject/e08b38f4b5a271eebfa74531948c0102
3、微生物组测序数据上传NCBI实操
https://www.genescloud.cn/cloudClassroom/video/single/3944facef821476c97230f5e73cd3367
在微生物组学的奇幻之旅中，从第一站的思路大派送，到第六站的秘籍全攻略，每一步都凝聚着我们对微生物组学奥秘的无限好奇与不懈追求。感谢每一位与我们一起踏上这段旅程的伙伴，希望这些干货满满的教程和秘籍助您在微生物组学的世界里游刃有余。让我们继续前行，在微生物组学的广阔天地中探索更多的未知，创造更多的可能。探索之旅，永远在路上！
