2024-12-16
表观多组学国自然基金资助情况
近年来国自然基金对于表观项目的投入以及相关项目的数量都是居高不下的,而多组学项目不管是经费投入还是项目数量近十年来是极速上升的状态。小编斗胆预测表观+多组学的研究绝对会成为2025年科研热点之一,表观多组学也可助力各位老师申请基金事半功倍。
表观多组学能做什么内容呢,如下关键词云图,表观遗传与动植物、人类疾病都是息息相关的,且DNA甲基化,组蛋白修饰等研究方法与转录调控、非编码RNA、代谢等组学也都是紧密相关的。
2014-2023年国自然表观多组学相关项目统计图(数据来源citexs)
表观关键词云图(数据来源citexs)
偷偷告诉您,以下表观产品小派都能做
千万要告诉别人哦!!!
基本概念
表观遗传学:DNA的序列不发生变化、基因表达改变、并且这种改变可稳定遗传。
表观基因组学:在基因组的水平上研究表观遗传修饰的领域被称为“表观基因组学”
多组学研究:是一种探究生物系统中多种物质之间互作的方法。其中包括基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、微生物组等多个组学,多组学之间的相互影响决定了表型和性状。
表观遗传分子机制(https://doi.org/10.3390/ijms25147927)
表观多组学基本研究思路
首先我们要了解为什么需要做多组学呢?多个组学之间可以结果串联,互相佐证,从不同的角度和深度去发现和解释生物问题,找到因果关系。
其次我们要怎样去确定多组学联合的方向呢?可根据有关联的生物理论基础来确定我们要做的组学,例如启动子区甲基化与基因表达负相关,就可以从WGBS和RNA-seq入手,从基因水平又可以研究蛋白水平,进而到代谢水平,层层关联,由因到果。
最后我们看下基础研究思路:
表观多组学高分项目文章集锦
文献一:Neuropeptide signaling orchestrates T cell differentiation
杂志:Nature(IF=50.5)
组学技术:CUT&Tag、ATAC-seq、scRNA-seq、bulk-seq
文章主题:作者利用多组学测序技术确定了一种神经免疫回路,在急性病毒感染期间,神经元通过产生神经肽CGRP参与T细胞命运决定,CGRP作用于表达RAMP3的T细胞,诱导有效的抗病毒TH1细胞反应。
技术路线:
派森诺客户表观组学研究成果荣登《Nature》!!!CUT&Tag、ATAC-seq助力揭秘神经肽信号调控T细胞分化
文献二:The Arabidopsis blue-light photoreceptor CRY2 is active in darkness to inhibit root growth
杂志:Cell(IF=45.5)
组学技术:chip-seq+转录组测序
文章主题:研究通过多组学测序技术结合生理生化实验揭示了CRY2在黑暗条件下的非典型功能,发现它能通过抑制FL1和 FL3与染色质的结合来降低细胞分裂基因的表达,抑制根系发育。
技术路线:
CNS宠儿!派森诺表观组学再登顶刊!Chip-seq助力《Cell》最新科研成果!
文献三:BRD9-mediated chromatin remodeling suppresses osteoclastogenesis through negative feedback mechanism
杂志:Nature Communications(IF=14.7)
组学技术:转录组+ChIP-seq+ATAC-seq
文章主题:作者通过构建疾病模型结合多组学测序技术,发现BRD9介导的染色质重塑可以通过负反馈机制抑制破骨细胞的发生,证明了BRD9对骨疾病的治疗具有一定的潜力。
技术路线:
转录组+ChIP-seq+ATAC-seq共同揭示BRD9在破骨细胞形成过程中的负反馈机制
文献四:Cryptococcal Hsf3 controls intramitochondrial ROS homeostasis by regulating the respiratory process
杂志:Nature Communications(IF=14.7)
组学技术:转录组+Chip-seq+代谢组
文章主题:作者利用多组学技术发现CnHsf3 (一种HSF蛋白)可以通过非典型的 UPR 途径调节线粒体内ROS (mtROS)稳态,以响应新型隐球菌的线粒体损伤。
技术路线:
转录组+代谢组+Chip-seq揭示隐球菌Hsf3通过调节呼吸过程控制线粒体内活性氧稳态
除上述项目文章,小派拥有的表观多组学项目文章数不胜数,想要更多可联系我们哦。
下面小编还为各位老师准备了多种“易消化”干货,请尽情“食用”。
干货分享 | 零基础了解表观遗传学,常见测序技术及问答看这里
干货 | 表观组学到底怎么用??一文秒变表观大佬,Chip-seq与ATAC-seq手到擒来!
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