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血浆蛋白组学重磅研究:人类健康与疾病血浆蛋白质组图谱

2025-01-16

在医学科技日新月异的当下,精准医疗已成为全球医疗领域的核心追求。它依据个体独特的基因、环境及生活方式等因素,定制专属医疗方案,大幅提升治疗的精准性与安全性。而血浆蛋白质组学,作为精准医疗领域的璀璨明星,正逐步揭开疾病与健康的神秘面纱,为临床研究开辟全新路径。

2024 年 11 月 22 日,复旦大学附属华山医院郁金泰、毛颖团队与类脑智能科学与技术研究院程炜、冯建峰团队在顶尖期刊Cell发表的研究成果,宛如一颗重磅炸弹,在医学研究领域掀起波澜,并登上《细胞》(Cell)杂志2025年开年封面。他们精心挑选了 53,026 名成年人作为研究对象,从其血浆样本中成功鉴定出 2,920 种蛋白质,纳入了1706种人类疾病与表型,绘制了一张全面的蛋白质组图谱,借助机器学习模型,挖掘出潜在疾病预测诊断标志物和治疗靶点 。这一过程就像在浩渺的生物宇宙中,精准定位了数千颗“生命星辰”。

Graphical abstract

为了探究这些蛋白质与疾病和健康特征的关系,研究团队采用了多种统计模型。针对 406 种常见疾病,运用逻辑回归模型进行横断面分析;对于 660 种新发疾病,则借助 Cox 回归模型开展纵向研究。在研究蛋白质与 986 种健康相关特征的关联时,依据特征的数据类型,分别使用线性回归、逻辑回归和比例优势逻辑回归模型。通过这些复杂且严谨的分析,构建出了一张庞大而精细的蛋白质与疾病、健康特征的关联网络。不仅如此,团队还通过敏感性分析确保结果的可靠性,运用生物信息学方法进行通路富集分析,挖掘蛋白质背后的生物学意义,并利用 LightGBM 算法构建预测模型,为后续研究筑牢根基。同时,采用孟德尔随机化分析,结合蛋白质定量性状位点(pQTL)数据,深入探索蛋白质与疾病之间的因果关系。

这项研究收获了一系列令人瞩目的关键成果,在疾病预测与诊断方面表现卓越。血浆中的特定蛋白质成为了疾病的“信号灯”,其表达水平与疾病发生风险紧密相连。例如 GDF15,与心脏疾病、代谢性疾病等多种病症的发生风险密切相关。通过监测这些蛋白质在早期的微妙变化,医生仿佛拥有了“未卜先知”的能力,能够提前预测个体患病的可能性,实现疾病的早期精准干预,大大提升治疗的成功率。而且,基于蛋白质表达模式的诊断方法犹如一台高精度的“扫描仪”,比传统手段更灵敏、更特异,能够精准区分不同疾病以及同一疾病的不同亚型,发现传统诊断难以捕捉的早期信号,为患者争取宝贵的治疗时间。

在探索疾病的潜在致病蛋白方面,研究团队借助孟德尔随机化分析和 pQTL 数据,成功确定了 474 个可能的因果蛋白。这些蛋白不仅与疾病存在关联,更可能是疾病发展的“幕后操纵者”。以 GDF15 为例,它或许在多种疾病的进程中起着核心推动作用,这一发现为疾病的生物学研究和治疗干预开拓了全新的方向,为开发更有效的治疗方法提供了全新的靶点。

在治疗靶点的探索上,研究团队通过深入剖析血浆蛋白质与疾病的关联,精准识别出在疾病发生发展中起关键作用的蛋白质,为药物重定位和新药开发带来了新的曙光。一些已有的药物可能通过重新定位,实现“跨界”治疗其他相关疾病。而对于尚无有效疗法的疾病,新发现的蛋白质靶点则为新药研发指明了方向。同时,基于个体蛋白质表达模式制定个性化治疗方案,能够显著提高治疗效果,减少副作用,真正实现精准医疗的目标。

Analytical workflow

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