2025-01-21
好消息！
PacBio旗舰单分子测序平台Revio迎来重大升级！
北京时间2024年10月30日凌晨，PacBio推出了SPRQ化学技术，这是HiFi测序自2019年发布以来的最重大更新。派森诺生物秉持紧跟科学发展前沿的原则，并在近期完成了第一批数据测试，接下来让我们一起来看一下SPRQ聚合酶的亮眼表现吧！
亮点1：数据量产出高且稳定
图 SPRQ升级前（左）后（右）单cell数据量产出
据统计，升级前PacBio Revio平台单cell平均产出90.69G数据，使用SPRQ试剂后单cell产出数据达到了惊人的135.49G，增长49.4%！
亮点2：数据准确性高
图 SPRQ升级前（左）后（右）Q值统计
升级前，大多数reads平均质量值(Q值)集中在30左右，使用SPRQ试剂后reads平均质量值集中在35-40，高质量reads占比明显增多，Q值达到38.56。
亮点3：长读长特点突出
图 升级后HiFi Reads长度分布部分统计结果
使用SPRQ试剂之后，PB长读长的特点依然比较突出，平均读长为17893bp。
亮点4：甲基化检测效果提升
图 SPRQ升级前（左）后（右）5mC检测的准确率统计
通过机载分析流程的算法升级，提升了5mC检测的准确率并新增了6mA检测。
亮点5：起始量低
据PacBio官方消息，SPRQ技术对样本的需求量不高，我们后续也将大幅下调HiFi测序的样本起始量，大家可以狠狠期待一波。
总结
实测数据表明，新试剂在保证了PacBio HiFi测序高精度和长读长特点的基础上，大幅度提高了通量，且同步提高了甲基化检测的准确率。
注：针对哺乳动物和常规作物等样本类型，派森诺承诺三代HiFi数据产出达110G以上。
派森诺三代全长适用产品：
基因组de novo ：针对基因组序列未知或参考基因组组装不理想的物种，构建不同类型的基因组DNA文库，并进行序列测定。然后使用生物信息学方法对序列进行拼接、组装和注释，从而绘制该物种完整的基因组序列信息。
全长转录组：基于PacBio三代测序平台的全长转录组测序，可直接获得mRNA的全长序列，更为准确地解读mRNA的结构信息。通过全长转录组测序，可克服无参考基因组物种转录本拼接短、信息不完整的难题，获取全长mRNA序列，实现同源异构体分析，单碱基变异检测， 可变剪接分析，同源基因识别及等位基因识别。
菌群多样性组成谱全长测序：基于PacBio三代测序平台，能够读取群落微生态系统中微生物的rRNA基因/ITS全长序列，不受制于短序列的局限性，并确保全长序列的测序，从而在种甚至菌株等精细水平，解析菌群多样性和组成谱。
三代宏基因组测序：三代宏基因组测序技术以其长读长、高准确性、低丰度微生物检测能力和高物种鉴定分辨率等特点，在多个领域展现出广泛的应用前景和重要的研究价值。基于PacBio HiFi测序技术的宏基因组测序，凭借长读长及Q30+的高测序准确度，可以轻松覆盖基因区间或基因特异性区域，大大降低了拼接错误，能快速精准的获得微生物信息，提高组装的完整度和注释的精确度。
