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转录组三部曲:从动植物研究到医学再到细菌调控的全面解析

2025-03-13

Highlights

1.转录组三部曲:新版真核有参转录组、医学转录组、原核转录组&原核转录组(链特异性)

2.三部曲需求场景:

真核有参转录:非医学模式生物基础研究;

医学转录:疾病机制与转化医学;

原核(含链特异性):细菌环境响应/致病机理。

3.零代码操作,数据集全流程自动化,支持多任务并行

PART·1、新版真核有参转录组分析

分析介绍

对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有mRNA进行测序,从整体水平分析基因功能以及基因结构,以发现不同生理或者病理状态下细胞、组织或个体内差异表达的基因。

平台优势:

  • 数据集一站式分析:批量配置一键启动,对分析内容+分组方案+分析参数同步勾选,全流程自动化执行。

  • 灵活分组与命名设置:自定义分组方案,命名方案,自由选择分组样品进行分析。

  • 高级绘图流程化:集成热图、趋势图、GSEA通路富集图等,直观展示数据。

  • 基因过滤高效化:支持从不同维度对基因进行筛选,帮助用户筛选出目标基因进行分析绘图。

PART·2、医学转录组分析

分析介绍

医学转录组是对人,大小鼠等医学常用模式动物,特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有mRNA进行测序的产品,主要应用为从整体水平分析基因功能以及基因结构,以发现不同生理或者病理状态下细胞、组织或个体内差异表达的基因。

专项升级:

在继承新版真核有参转录组分析的核心优势基础上,针对医学转录组分析进行数据库升级:

💠多维度数据库支持:

a. 常规数据库:GO(基因功能注释)、KEGG(通路分析)提供基础生物学洞见。

b. 医学专项数据库:DO、Reactome 和 DisGenet数据库以及GSEA医学数据库。

PART·3、原核转录组分析&原核转录组(链特异性)分析

分析介绍

原核转录组在RNA层面,对细菌在不同的环境、宿主、实验处理下的基因表达情况进行全面研究,从整体水平分析基因功能及结构,挖掘不同实验设计下潜在的分子机制,阐明生物学问题。

平台特色

在继承新版真核有参转录组分析的核心优势基础上,针对原核生物新增章节:

结构分析个性化:新增新转录本分析、sRNA分析以及反义转录本分析等内容。

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