2025-04-10
单细胞转录组分析可视化系统
针对单细胞转录组数据的复杂性,构建“数据预处理 → 分析模块 → 可视化输出”全流程解决方案,重点突破细胞集构建灵活性、分析逻辑前置化、高阶图表可视化三大核心需求。
一、新建细胞集模块:灵活构建细胞数据集
该模块支持多元创建方式,使科研人员能够根据实际需求,灵活构建细胞数据集。具体功能包括:
✅ 基于细胞质控结果创建
✅ 单个细胞交互式框选创建
✅ 多个细胞集合并创建
✅ 细胞注释标签轻松修改
✅ 细胞重命名
✅ 细胞亚群与母群之间的映射
二、分析模块:从分析到绘图的一站式流程
该模块遵循“先分析,基于结果再去绘图”的原则,提供5大分析内容:
① 创建差异分析 :基于Marker基因与差异表达分析,揭示细胞群体间的基因表达异质性。
② 创建富集分析 :数据库覆盖GO、KEGG及自定义基因集,另外系统提供自定义上传基因列表。
③ 创建拟时序分析 :可自由选择monocle2和monocle3进行分析,动态调整参数优化轨迹拓扑结构。
④ 创建细胞通讯分析:通过是否组间对比来,过滤要参与分析的细胞。
⑤ 创建基因集打分分析:灵活选择打分方式,支持上传基因集打分的数据进行分析。
三、高阶可视化全流程覆盖:直观展示分析结果
云分析系统提供了高阶可视化功能,让我们能够直观地展示分析结果。具体功能包括:
细胞图谱:UMAP / Tsne图、barplot等细胞图谱可视化;
基因可视化:气泡图、热图、基因映射图、小提琴图等高级分析图片可视化;
功能解析:富集分析图(GO / KEGG / GeneSet )。
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温馨提示:平台现已正式接入DeepSeek-R1满血版,您可以根据需求切换不同模型进行体验。在绘图过程中,如果遇到常见问题,建议先使用PAI绘图小助手进行自助解决;若有个性化需求或遇到无法解决的问题,欢迎通过【工单中心】与平台联系,提出您的需求或建议。
派森诺基因云始终秉持“持续创新,不断升级”的理念,未来将推出更多精美的可视化图表与实用的分析工具,期待您的使用与反馈!