2025-05-30
派森诺生物自2019年与10x Genomics 建立深度合作以来，已有6年的单细胞服务经验。服务内容涵盖单细胞与空间转录组测序全流程，可提供从样本处理到文章发表的一站式解决方案。样本解离能力卓越，已成功应对超 100 种物种、800 多种组织样本，特别是在疑难样本的解离上优势尽显。
前 言
GEM-X单细胞解决方案是基于Chromium X系列仪器，对前版本Next GEM做的全新升级。其通过微流控芯片架构与试剂系统的协同优化，为单细胞转录组测序带来了前所未有的提升。
GEM-X做了哪些优化？
1、优化微流控体系，中位基因值显著提升
单细胞实验中，单个的细胞从组织中被解离下来后是极其脆弱的。GEM-X在旧版的基础上升级为双十字微流控体系，将运行时间从18min降低至6min，缩短了单个细胞在体外的时长，这极大程度上减少了细胞中核酸的降解。
Next GEM微流控体系
GEM-X微流控体系
细胞捕获动态图
实际表现：
分别用新版GEM-X和旧版Next GEM方案，测试了PBMC、神经元细胞、脑组织、肺癌组织4种样本，GEM-X的基因检出率增加38%-98%。
GEM-X方案的中位基因值显著提高
2、试剂优化，细胞捕获效率明显提升
在实验研究中，试剂犹如 “基石” 与 “灵魂”，对实验的成败、数据的可靠性起着决定性作用。本次 10x Genomics 推出的 GEM-X 单细胞解决方案，围绕实验流程展开革新，对全套试剂进行了大幅优化。
GEM-X全套试剂盒
实际表现：
细胞捕获效率提升至80%。在实际案例中，用GEM-X和Next GEM分别测试了小鼠脑组织样本。Next GEM共捕获了17527个细胞，GEM-X共捕获了21332个细胞，细胞捕获数提高了21%。
GEM-X细胞捕获数量显著提升
GEM-X中细胞的Marker基因丰度明显提升
3、全新芯片，脆弱细胞捕获率提升
另外，GEM-X还对芯片内部结构进行了升级，极大的提高了芯片的通量、灵敏度和灵活性。
实际表现：
在单细胞研究领域，脆弱细胞因极易发生凋亡而难以有效捕获。全新芯片的加持改善了这一问题。以人白细胞样本为例，作为典型脆弱细胞的中性粒细胞，其捕获数量在 GEM-X 技术加持下实现了约 3 倍的显著增长，细胞类型占比也得到大幅提升。
脆弱细胞类型占比显著提升
派森诺实测数据展示
用GEM-X（V4）和Next GEM（V3）分别测试了人脑癌组织样本。结果显示，相较于 Next GEM，GEM-X在多项关键指标上实现明显提升：中位基因值大幅提升，细胞捕获数量显著增加，同时检测到的基因总数也有明显增长。
实测数据表
（其中V3和V4-测试1投入细胞数均为1.85万，V4-测试2投入细胞数为2.9万）
实测数据对比
实测cellranger结果
V3
V4-测试1
V4-测试2
结 语
GEM-X 的问世，重塑了单细胞研究的技术标准，无疑会推动生命科学研究迈向更高维度。目前，派森诺生物GEM-X单细胞解决方案已开启订购，诚邀广大科研工作者们前来体验。
