2025-06-06
研究物种：小鼠
发表期刊：Phytomedicine
发表时间：2025年
影响因子：6.7
文章亮点
1.多组学整合策略
研究创新性地结合了肠道菌群分析、代谢组学和蛋白质组学，系统揭示了芍藤汤（STD）治疗干燥综合征（SS）的多层次作用机制，突破了单一组学研究的局限性，全面解析了微生物-宿主互作网络。
2.肠道菌群调节作用
发现芍藤汤显著恢复SS模型小鼠的肠道菌群失衡，增加有益菌（如乳杆菌属）丰度，减少条件致病菌（如脱硫弧菌属），并通过调节菌群代谢功能（如短链脂肪酸合成）改善肠道微环境。
3.关键代谢通路与生物标志物
代谢组学鉴定出血清和结肠中差异代谢物（如胆汁酸、色氨酸代谢产物），提示芍藤汤通过调控“色氨酸-犬尿氨酸-AhR通路”减轻炎症，同时激活FXR信号通路改善胆汁酸代谢紊乱。
4.蛋白质组学揭示免疫调节机制
蛋白质组分析显示，芍藤汤下调促炎因子（如TNF-α、IL-6）和补体系统蛋白，上调紧密连接蛋白（Occludin）和抗炎蛋白（如IL-10），通过修复肠道屏障、抑制NF-κB通路缓解全身性自身免疫反应。
5.菌群-代谢-免疫轴机制验证
通过相关性网络分析，建立了特定菌群（如Alloprevotella）与代谢物（次级胆汁酸LCA）、免疫指标（Th17/Treg平衡）的强关联，证实芍藤汤通过“肠-免疫轴”调节Th17/Treg分化，纠正免疫失衡。
6.中医药现代化研究范式
研究为复方中药的系统药理学机制提供了模板，通过多组学数据整合阐明“多成分-多靶点-多通路”协同作用，推动传统经验方剂的科学化阐释。
研究背景
干燥综合征（Sjogren's syndrome，SS）是一种复杂的自身免疫性疾病，而STD已被证明可以有效改善SS患者的炎症损伤和免疫功能障碍，但其确切机制尚未明确。本研究旨在探讨STD对SS治疗的作用机制，确定潜在的治疗靶点及其相互关系。
研究思路
本研究以非肥胖糖尿病（NOD）小鼠作为疾病模型。通过网络药理学分析性病治疗对SS的潜在信号通路，并通过病理染色、ELISA和免疫组织化学评估性病在减轻炎症损伤中的作用。此外，应用肠道微生物群、代谢组学和蛋白质组学分析，鉴定关键微生物群、代谢物和蛋白质，旨在寻找STD潜在的作用靶点，并利用Western blotting和免疫组织化学验证相关靶点的真实性，探究三者之间的相互作用。
研究方法
16SrRNA测序、蛋白组，代谢组学、网络药理学
研究结果
1、在正负离子模式下STD的化学成分分析
2、网络药理学分析
在TCMSP和GeneCards数据库分析中鉴定到了64个常见基因的交集，包括TNF、IL6、NCOA1、AKT1和TP53。GO和KEGG分析显示它们主要与影响肿瘤坏死因子受体结合等途径和TNF和IL-17等信号通路相关。
3、STD减少了腺体组织损伤和炎症反应
利用STD对NOD小鼠进行治疗，发现STD能显著降低NOD小鼠中下颌下腺组织淋巴细胞浸润，保护腺体结构，增加AQP1和AQP5表达水平，降低血清中促炎细胞因子TNF-α和IL-17的水平。
4、STD调节NOD小鼠肠道菌群失调
研究通过16s rRNA测序分析来确定STD对NOD小鼠肠道菌群失衡的影响。结果显示STD能显著调节NOD小鼠肠道微生物群落结构，能够通过降低Proteobacteria丰度，增加Alistipes和Odoribacter等丰度改善肠道微生物群的失衡。
5、STD改善NOD小鼠粪便代谢物失调
研究通过UHPLC-Q-TOF/MS分析显示STD对不同组小鼠中粪便代谢物组成有显著影响，共鉴定到691种差异代谢物，其中脂类和类脂分子占比最高。KEGG分析显示胆汁酸生物合成是改善NOD小鼠疾病状态的主要代谢途径。
6、STD改变了NOD小鼠的蛋白质组学特征
随后，研究进一步通过蛋白质组学分析发现STD能够显著恢复NOD小鼠的蛋白质表达趋于正常水平，同时鉴定了到17个DEPs，其中与能量代谢相关蛋白在STD-H组显著上调，而免疫反应相关蛋白下调。GO和KEGG分析显示这些DEPs主要与氧化磷酸化和抗原处理呈递等关键通路相关。此外，研究发现关键DEPs中IfI30表达显著降低，Ndufv3和Ndufs6显著升高，并且STD高剂量组（STD-H）变化更明显。
7、NOD小鼠颌下腺组织中关键DEPs的验证结果
之后，研究进一步利用WB和免疫组化染色对IfI30、Ndufv3和Ndufs6的蛋白表达水平进行验证，得到了与蛋白质组学相同的结果，即STD-H组中IfI30表达显著更低，Ndufv3和Ndufs6表达显著更高。
8、相关性分析
最后，研究对筛选出的7个肠道菌群、7个差异代谢物和17个组间相交的DEPs做出了进一步的相关性分析，并构建了相关网络图。结果显示STD主要通过调节变形菌群丰度、胆汁酸生物合成代谢途径以及调节蛋白IfI30、Ndufv3和Ndufs6的表达来改善NOD小鼠的疾病状态。
小 结
文章在方法上整合了多组学（微生物组、代谢组、蛋白质组）和网药分析，并在选题上结合了肠道微生物群，揭示了STD在SS中的作用机制。
参考文献链接：
Pang F, Jiang Q, Li K, Tang X. Integrative gut microbiota, metabolomics and proteomics studies unraveled the mechanism of Shaoteng decoction in treating Sjogren's syndrome. Phytomedicine. 2025 May;140:156631. doi: 10.1016/j.phymed.2025.156631. Epub 2025 Mar 7. PMID: 40088738.
