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蛋白定量系统3大核心功能全拆解,附实操指南

2025-08-06

为满足科研中对蛋白定量分析日益增长的需求,我们的蛋白定量云分析系统新增诸多实用功能与内容。为了帮助您快速上手新产品,下面将围绕蛋白集的创建方式、比较组方案的新建以及差异蛋白筛选这三项关键内容,为您详细介绍具体用法,让您能迅速掌握系统操作,快速完成分析任务。

一、蛋白集的创建和运用

1. 蛋白集的创建方式

a.自定义上传蛋白集文件:可自行上传蛋白集文件,上传成功后,能将所有的蛋白集文件进行任意合并,从而创建新的蛋白集。

b. 通过蛋白表创建

  • 差异蛋白表:用差异蛋白表创建蛋白集,创建成功后,可通过切换蛋白表来查看该蛋白集。

  • 功能富集创建的蛋白表:在分析设置的蛋白集下拉选项中,可切换基于此方式创建的蛋白集数据。

  • 富集表:通过富集表创建蛋白集时,无需在页面进行额外操作。

c.通过维恩图创建:点击维恩图图上显示的数据,来创建蛋白集,创建成功之后在分析设置模块,可以找到新建的蛋白集。如果想要对新创建的蛋白进行分析,请至少选择两组蛋白数据进行分析。

2. 蛋白集查看管理:对于已经创建成功的蛋白集,我们可以在蛋白集管理页面进行统一查看。

二、比较组方案的创建和运用

1. 两两比较方式

  • 非配对样品比较:此方式无需对样品进行配对,直接将两两分组进行比较。

  • 配对样品比较:针对两两分组中的样品开展一对一比较。同时,对于处理组的分组中的样品,系统提供下拉切换功能,方便我们选择不同样品,让样品调整更加灵活。

  • 单样品比较:要求分组方案对应的样品必须是单样品,若存在多个样品,需要修改对应的分组的数量,上传分组方案后,再去新建比较方案。

2. 多组比较方式: 分组大于等于三组,才能进行比较分析。

三、差异蛋白筛选方式新升级

1. 筛选流程优化:增加先对筛选结果进行过滤的步骤,查看结果满意之后再进行提交,以此提高分析效率。

2. 筛选方式

  • 分区筛选:分别对UP和DOWN蛋白进行筛选,有助于精准定位关键差异蛋白。

  • 总体筛选:通过取TOP值的方式进行筛选,能够快速获取最具显著性的差异蛋白。

  • 自定义筛选:可复制Protein_ID进行筛选,满足特定的筛选需求。

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