前 言
2025年，派森诺生物始终将“服务至上”理念深度融入科研合作全流程——从前期项目方案的个性化定制、中期多组学技术的精准执行，到后期数据分析的深度挖掘与成果解读，全方位响应科研团队的核心需求，依托覆盖基因组、转录组、蛋白质组、代谢组及微生物组的全维度技术平台，凭借扎实的技术储备与持续的创新能力，在生命科学研究的关键赛道（包括基础医学、农业生物技术、环境生态学、微生物资源开发等）持续迸发活力，成为科研团队成果产出的重要助力，推动众多合作项目的高分文章相继在国内外舞台亮相。
截至2025年8月，派森诺生物合作发表的项目文章数量达1100+篇，累积影响因子达6200+分，呈现“量质双高”。其中，影响因子超过10分的高水平文章超120篇，发表国际顶级学术期刊涵盖Nature、Cell、Molecular Cell、Nature Communications、Advanced Science、Microbiome、Molecular Plant、Eco-Environment & Health及Small等，全面覆盖生命科学多个细分领域的顶级学术阵地。为帮助更多科研工作者精准把握领域研究热点、拓宽创新思路，本期内容中，小编特别精选了多篇具有代表性的高分文章案例进行分享，为大家的基础研究突破、跨领域课题探索及高水平成果发表提供切实可行的思路参考与经验借鉴。
项目文章一
基因工程改造后的需钠弧菌对复杂有机污染物的生物修复作用
发表期刊：Nature
影响因子：48.5
技术热点：16S测序、基因组、代谢组、转录组、qRT-PCR验证等
文章简介
为了解决微生物的生物修复受限难题，亟需建立一株能够修复一系列污染物的菌株。研究团队筛选出需钠弧菌作为底盘菌株，其在30-50g/L盐浓度下生物量和污染物耐受性更高，转录组分析发现其外排泵及ABC转运蛋白基因在污染物压力下上调，增强排毒能力。通过整合tfoX基因构建VCOD-2，转化效率提升且无抗性标记残留。选定chr2_297为最优插入位点，构建的VCOD-3至VCOD-11中，5个菌株具降解能力。开发INTIMATE技术构建的VCOD-15，48小时内对5种污染物去除率超60%，在高盐废水和土壤中表现稳定，能高效降解污染物，且插入基因簇不影响生长，遗传稳定。这些成果为应对全球海洋生物安全威胁提供了新的技术手段，在处理工业废水、石油污染和塑料污染等领域具有重要的应用潜力。
本研究涉及转录组、微生物组、基因组、代谢组等组学，派森诺提供了微生物组+转录组测序及部分分析服务，具体研究方案如下：
项目文章二
拟南芥蓝光受体CRY2在黑暗中具有抑制根系生长的活性
发表期刊：Cell
影响因子：42.5
技术热点：ChIP-seq、Shotgun、转录组、co-IP、pulldown等
文章简介
隐花色素（CRYs）作为一类蓝光受体，但非光激发状态的CRYs在黑暗或非蓝光环境中的作用及其机制仍不清晰。通过转录组分析，研究团队发现CRY2在黑暗中对基因表达的影响强于蓝光下，且参与多种生物过程。表型分析显示，黑暗中CRY2通过抑制根尖分生区细胞分裂及相关基因表达，抑制根伸长，蓝光可减弱该作用。进一步研究发现，CRY2在黑暗中与FL1、FL3发生物理相互作用（蓝光会抑制该作用），且FLs在蓝光下通过促进细胞分裂基因转录促进根伸长。遗传互作实验表明FLs在CRY2下游发挥作用，CRY2在黑暗中抑制FLs与细胞分裂基因染色质的结合，蓝光下该抑制解除，从而协调根系生长。
研究技术路线
项目文章三
中介体通过与前体mRNA 3'端加工因子的串扰调控转录终止
发表期刊 ：Molecular cell
影响因子：14.5
技术热点：Cut&Tag-seq、ChIP-seq、CLIP-seq、转录组、LC-MS/MS等
文章简介
中介体复合物（Mediator complex）除了在转录起始中的作用外，还参与协调转录延伸和mRNA剪接过程。本研究揭示了中介体复合物通过MED23-FIP1的相互作用调控转录终止的分子机制。研究团队发现，中介体复合物通过MED23与前体mRNA 3'端加工复合体CPSF中的FIP1结合，这种相互作用不依赖于RNA或DNA，且可能通过相分离实现。MED23是一种RNA结合蛋白，具有两个RNA结合结构域，能特异性结合含CU-rich基序的3' mRNA。MED23或FIP1的缺失，以及FIP1特定片段的过表达，会破坏中介体与CPSF的关联，导致转录通读和融合转录本的产生，而MED23的RNA结合能力对此调控至关重要。此外，MED23在多种癌症中表达降低，其缺失与乳腺癌中的转录通读相关，可能影响癌症进展和患者生存，为癌症发生机制及潜在治疗靶点提供了新见解。
项目文章四
靶向神经酰胺转移蛋白通过GRP78-ATF6-CHOP轴增强AML对FLT3抑制剂的敏感性
发表期刊：Nature communications
影响因子：15.7
技术热点：转录组、靶向代谢组等
文章简介
神经酰胺转移蛋白（CERT）决定细胞中神经酰胺与鞘磷脂的比例，靶向CERT可使实体癌细胞对化疗敏感，但在急性髓系白血病（AML）中的作用尚不明确。研究团队发现，CERT在FLT3-ITD突变的AML细胞中高表达，用HPA-12抑制CERT或基因敲低CERT，可剂量依赖性抑制该类细胞生长并促进凋亡，对FLT3-WT细胞影响小。HPA-12与FLT3抑制剂Creno联合使用，对FLT3-ITD突变AML细胞的抑制效果显著优于单药，具强协同作用，对FLT3-WT细胞呈拮抗。在AML异种移植小鼠中，联合治疗能降低白血病负荷、延长生存期。机制上，联合治疗诱导神经酰胺在细胞内质网积累，激活内质网应激-GRP78/ATF6/CHOP轴和线粒体自噬。靶向CERT与FLT3抑制剂联用，可通过GRP78-ATF6-CHOP轴和线粒体自噬等机制，增强FLT3抑制剂在AML治疗中的疗效，为AML治疗提供了新的有效策略。
项目文章五
KK2DP7刺激脾脏中CD11b+细胞群引发抗肿瘤治疗的训练免疫
发表期刊：Advanced science
影响因子：14.3
技术热点：ATAC-seq、转录组、FACS分选/分析等
文章简介
树状肽KK2DP7作为免疫调节肽衍生物，被选作模型佐剂以探索其通过训练免疫增强抗肿瘤效应的机制。研究团队发现，KK2DP7可通过诱导训练免疫发挥抗肿瘤作用。在小鼠模型中，KK2DP7能显著延缓肿瘤生长，延长生存期，且效果与已知训练免疫激动剂β-葡聚糖相当，对多种肿瘤有效且无明显毒副作用。研究证实，其作用依赖于脾脏，脾切除后抗肿瘤效果消失。进一步发现，脾脏非淋巴区的CD11b⁺细胞是关键靶标，该细胞经KK2DP7训练后，会分泌特征性细胞因子，且增殖、吞噬和杀肿瘤能力增强，过继转移给naive小鼠可传递抗肿瘤能力。机制上，KK2DP7通过激活TLR2-IRF7轴，引发CD11b⁺细胞表观遗传重编程。
项目文章六
后肠微生物组稳态破坏通过抑制乙酸介导的肝脏AMPK-PPARA轴促进反刍动物产后能量代谢紊乱
发表期刊：Microbiome
影响因子：13.8
技术热点：16sRNA、宏基因组、转录组、非靶代谢组、短链脂肪酸靶向代谢组等
文章简介
本研究以奶牛为模型，探究后肠微生物群稳态破坏对奶用反刍动物产后能量代谢紊乱的影响及机制。研究团队将88头健康奶牛与62头酮病奶牛作为对比，通过多组学分析和体外实验发现：酮病奶牛存在代谢紊乱，表现为血液中β-羟基丁酸等指标异常及肝脂肪变性。其粪便微生物群与健康奶牛差异显著，基于后肠微生物群的随机森林模型可较准确预测产后酮病（AUC=0.741）。宏基因组与代谢组学分析显示，健康组中Faecousia等菌属丰度高，可调节肠道乙酸浓度；酮病组中Methanosphaera等菌属占优。乙酸通过肝脏AMPK-PPARA轴抑制脂肪沉积并减少β-羟基丁酸生成，而酮病奶牛后肠乙酸缺乏。
部分精选文章案例
