2025-09-02
细胞集的创建是单细胞数据分析中的核心环节，细胞集创建分为两大模块，包含6种创建细胞集的方式，分别是基于细胞质控结果创建、单个细胞交互式框选创建、多个细胞集合并创建、细胞注释标签修改、细胞重命名、细胞亚群与母群之间的映射。通过以上方式，我们可以灵活创建细胞数据集。文章还将详细说明功能页面中的各项参数，以帮助科研人员更好地理解与使用本平台。
一、细胞集创建
1.基于细胞质控结果创建
简介：基于细胞质控的结果，可一键创建细胞集，对质控得到的高质量细胞群进行聚类分群以及使用cellID软件参考派森诺自助研发的注释marker基因数据库（PSN_Marker_V1）进行自动注释。
2. 单个细胞交互式框选创建
创建方式：单个细胞集除了通过类群名来选择要分析的亚群细分的细胞类型，还可以继续在降维图（如Umap/Tsne）上框选细胞去分析。
3.多个细胞集合并创建
创建方式：可以下拉选择多个细胞集进行合并分析。
4.细胞注释标签修改
功能：单细胞聚类分析生成的细胞亚群添加生物学标签。可根据标记基因或已知特征，手动或自动为每个Cluster赋予具体名称。
5.细胞重命名
功能：支持对现有细胞类型命名支持直观快捷修改。
6.细胞亚群与母群之间的映射
功能：通过构建细胞亚群与母群之间的层次关联，实现细胞亚群标签向母群的精准映射。
二
细胞集可视化
根据创建成功的细胞集名称，通过下拉选择可快速调取对应结果。从聚类分群图谱（Umap/Tsne）、亚群注释细胞注释barplot图，来展示细胞集结果分析可视化。
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