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单细胞测序项目经验合集-植物样本抽核

2025-09-12

在植物单细胞测序研究中,获取高质量的细胞核是后续实验成功的关键前提。相较于原生质体分离,植物样本抽核技术能突破细胞壁坚韧、组织纤维化等限制,适用于更多难解离的植物组织(如木质化茎秆、成熟种子),且能有效保留细胞异质性。今天,我们就从抽核方法,常见问题与解决方案,全方位分享植物样本抽核的实战经验,帮你避开科研 “坑点”。

派森诺单细胞平台已成功完成5000+单细胞样本测序,有着丰富的项目经验,以下是部分派森诺曾做过的植物组织抽核样本类型:

一、抽核方案

1. 样本处理

冻存的植物组织在液氮中研磨成粉末状,转移至5ml管中备用。

2. 细胞核释放

加入3ml NIB裂解液,使用组织研磨仪磨碎组织,使细胞核释放,DAPI观察细胞核释放情况。

3. 清洗

使用NB溶液终止细胞核裂解,离心(根据不同组织类型调整离心力,范围在500-1000g),5min。

4. 去杂质

通过流式分选DAPI阳性的细胞核,进行去杂质处理

5. 质检

流式分选后的细胞核离心,合适体积重悬后使用AOPI染料计数,荧光显微镜观察细胞核完整度。

二、常见问题与解决方案

1. 细胞核破裂率超过 20%怎么办?

  • 研磨时减少时间(如从 5min 缩短至 3min),或更换为玻璃匀浆器(力度更温和);

  • 降低离心转速(如从 1000×g 降至 800×g),延长离心时间(从 10min 增至 15min)。

2. 细胞质 / 杂质污染严重怎么办?

  • 增加过滤次数(如先用 70μm 筛网初滤,再用 40μm 筛网精滤),并确保每次过滤后用 NB 冲洗筛网;

  • 在 NIB 中加入 2% PVP(去除酚类杂质)

三、部分结果展示

杨树根尖

杨树叶片

杨树茎

棉花根

柳树叶片