你是否想过，一味中药或一个复方为何能治疗多种症状？其背后的科学逻辑，正被一门名为「网络药理学」的前沿学科逐步揭开。
这门由英国科学家Andrew L Hopkins于2007年开创的交叉学科，融合系统生物学、大数据分析和人工智能技术，从宏观系统层面解读药物与机体的复杂互动，彻底改变了“一药一靶治一病”的传统研发模式，引领多靶点、网络化研究的新方向。
而这一理念，与中医整体观、辨证论治的思想不谋而合。中药复方讲究君臣佐使的配伍智慧，通过多成分、多途径、多靶点的协同调控，实现人体动态平衡的恢复。网络药理学恰恰为解读这份千年智慧提供了新方法、新工具和新视角。
五大步骤解析中药作用机制：
精准筛选：从中药中挖掘有效活性成分
靶点预测：智能算法推断成分作用靶标
疾病关联：构建疾病相关靶点图谱
靶点整合：锁定中药调控疾病的关键节点
网络构建：可视化呈现“成分-靶点-通路”多维网络
网络药理学分析步骤
如今，网络药理学已成为研究中药复方作用机制、挖掘配伍规律、指导临床合理用药和创新药物研发的重要支撑，真正让传统中医药焕发现代科学光彩。
派森诺网络药理学分析
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派森诺网络药理学分析流程
派森诺网络药理学部分分析内容
化合物靶点与疾病靶点韦恩图
蛋白互作网络分析
中药-活性成分-靶点-通路-疾病桑基图
中药-活性成分-靶点-通路-疾病网络图
研究案例
益脉颗粒通过调节肠道微生物群和代谢产物改善高脂饮食诱导的小鼠非酒精性脂肪肝
研究物种：小鼠
发表期刊：International Journal of Microbiology
发表时间：2025年
影响因子：3.2
研究背景
高发病率与“隐形杀手”：NAFLD已成为全球最常见的慢性肝病，与肥胖、2型糖尿病等代谢综合征密切相关。早期症状隐匿，但可进展为非酒精性脂肪性肝炎（NASH）、肝纤维化、肝硬化甚至肝癌，对公共健康构成巨大威胁。
目前，临床上缺乏批准用于治疗NAFLD/NASH的特效药物。标准治疗方案主要依赖于生活方式干预，如减肥和饮食控制，但患者依从性往往较差。因此，开发新的有效药物是当前医学研究的迫切需求。近年来，越来越多的证据表明，肠道与肝脏之间通过门静脉紧密相连，存在双向对话，即 “肠-肝轴”。肠道菌群失调被认为是NAFLD发生发展的关键因素之一。增加肠道通透性，导致细菌内毒素（如LPS）进入门静脉循环。有害代谢物增多：产生更多的有害物质（如内毒素、吲哚等）。短链脂肪酸（SCFAs）、胆汁酸等有益代谢物的产生和代谢发生紊乱。这些变化会触发肝脏的炎症反应、胰岛素抵抗和脂质代谢紊乱，从而驱动NAFLD的进展。因此，调节肠道菌群已成为治疗NAFLD的一个极具潜力的新策略。中药复方具有“多成分、多靶点、整体调节”的特点，这与通过调节肠道微生态这一复杂系统来治疗复杂性疾病（如NAFLD）的理念高度契合。益脉颗粒的既往证据：益脉颗粒（Yi Mai Granule）是一个中药复方，可能基于前期临床观察或研究，显示出对心脑血管或代谢性疾病的潜在益处（从其名称“益脉”可推断其可能与活血、通脉有关）。尽管可能有效，但益脉颗粒是否对NAFLD有治疗作用，特别是其作用机制是否与当前前沿的“肠-肝轴”理论有关，是完全未知的。其如何影响肠道菌群结构及其功能（代谢物），又如何将这些变化与肝脏改善联系起来，是本研究旨在解决的核心科学问题。
技术路线
部分研究结果展示
1.YMG网络药理学分析
经TCMSP数据库筛选，YMG中共获得224种有效化合物，其中半夏13种，党参21种，黄芪20种，茯苓15种，白术7种，甘草92种，天花粉11种，桃仁23种，红花22种。删除重复项后，保留了203种YMG有效化合物和279个相应靶点。分别从Gencards、CTD和DisGeNET数据库中获得了1682、15050和471个血脂异常靶点，在体重缺失后获得了15091个疾病靶点。共有266个YMG目标相交（图4A）。
将交叉靶标导入STRING数据库以获得PPI网络，并使用CytoHubba插件进行可视化。选择并交叉了前40个MNC、Degree、EPC和MCC目标，获得了31个核心目标（表3），然后将其导入STRING数据库，以获得核心目标的PPI网络。PPI网络包括31个节点和652条边（图4B）。
KEGG通路富集分析显示了182条信号通路，包括PI3K-Akt、TNF、IL-17、凋亡、NAFLD以及脂质和动脉粥样硬化信号通路（图4C）。
如图4D所示，使用前20条信号通路及其相应的靶标和化合物构建了化合物靶向通路网络，其中绿色圆圈、蓝色菱形和橙色矩形分别表示化合物、靶标和通路。根据表3和复合靶信号通路分析，对筛选通路中与NAFLD相关的caspase-3、CYCS、IL1β、IL6、PPAR、RXRA、TNF和NF-κB 65蛋白进行了蛋白质印迹验证。
益脉颗粒网络药理学分析
2.利用YMG构建微生物代谢产物脂质调节网络以改善NAFLD
构建Spearman相关热图，并进行相关网络分析，探讨YMG调节肠道微生物群和代谢产物改善NAFLD的机制。热图（图8A）显示了血脂指标与前20种不同的肠道微生物群、代谢物和核心蛋白之间的相关性。相关网络分析显示，血脂指标、肠道微生物群和代谢物之间存在差异。这表明，前20种不同的肠道微生物群对代谢物、核心蛋白和血脂指标具有不同的调节作用。
基于Spearman分析绘制了关联网络，以进一步探索肠道微生物群、差异代谢物、核心蛋白和血脂指标之间的复杂调控关系（P<0.05，R>0.5）（图8B）。关联网络显示，小鼠的血脂指标、核心蛋白、前20种不同的肠道微生物群和代谢物之间存在相关性，包括正相关和负相关。结果表明，YMG可能通过各种肠道微生物群和代谢产物对NAFLD小鼠的血脂具有调节作用。
多组学联合分析
研究结论
本研究表明，YMG可以改善HFD诱导的NAFLD小鼠的病理，并表明这些调节作用与肠道微生物功能和血清代谢物的变化有关。同时，网络药理学结果表明，YMG对非酒精性脂肪肝途径及其核心靶点具有一定的调节作用。然而，由于TMC成分和调控机制的复杂性，YMG改善NAFLD的分子机制需要进一步阐明。目前的研究清楚地强调了YMG对改善NAFLD进展的治疗价值。此外，本研究为利用生物信息学方法研究中药方剂治疗NAFLD的机制提供了新思路。本研究可能为YMG治疗NAFLD的临床应用提供理论依据。
参考文献
Pang L, Liu Y, Yuan C, Ju Y, Wu J, Cheng M, Jin S, Fan Y, Zhang H, Wang Y, Min D. Yi Mai Granule Improves High-Fat Diet-Induced Nonalcoholic Fatty Liver Disease in Mice by Regulating Gut Microbiota and Metabolites. Int J Microbiol. 2025 Mar 23;2025:2273986. doi: 10.1155/ijm/2273986. PMID: 40166691; PMCID: PMC11955292.
