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全基因组重测序检测自闭症突变特征

2016-10-28

研究背景

自闭症,又称孤独症,主要特征是漠视情感、拒绝交流、语言发育迟滞、行为重复刻板以及活动兴趣范围的显著局限性,一般在3岁以前就会表现出来。其发病原因有多种,已确定遗传因素对自闭症作用明确,但具体因素尚不明确。


研究结果 

新生突变(de novo mutations, DNMs)是导致自闭症的重要因素,此前对自闭症新生突变的研究中,只对编码区的1.5%基因进行过测序。研究者选取了200对父母和孩子的种系样品,通过Hiseq平台对样品进行了全基因组的重测序。结果发现大部分种系DNMs(75.6%)来自父亲,且随着父亲年龄增加而增加。然而,大部分簇的DNMs来自于母亲,且与新生CNVs突变相邻。同时,检测到大量有破坏性的突变存在于非编码区(15.6%)和遗传非编码区(22.5%),虽然这些非编码区的突变基因不会被翻译,但是他们参与调控外显子跳跃或者处于脱氧核糖酶I的高敏感区域。

对发生DNMs突变类型进行统计,具体结果见图1。

 

图1:DNMs突变类型


对样品的家系、簇族和体细胞的突变进行检测,分析突变来源,具体结果见图2。

 

 图2:自闭症突变来源检测


同时,通过重测序对样品中破坏性的突变进行检测,同时验证这些突变对功能的影响,具体结果见图3。

 

 图3:破坏性突变对功能的影响


结论 

研究者通过对200个家庭共600人进行了全基因组的重测序,对自闭症进行了研究,为自闭症提供了各种类型基因突变类型的阈值模型,对自闭症的遗传因素有更新的认知。

参考文献 

Yuen, RK, et al. Genome-wide characteristics of de novo mutations in autism. NPJ genomic medicine, 1, 16027-1.