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动物线粒体全基因组测序知多少?

2016-03-21

   什么是线粒体基因组?  

 


   线粒体    

 

       线粒体(Mitochondrion)是一种存在于大多数真核细胞中的由双层膜包被的细胞器。它是细胞中制造能量的结构,是细胞进行有氧呼吸的主要场所,被称为“power house”。除了为细胞供能外,线粒体还参与细胞分化、细胞信息传递和细胞凋亡等过程,并拥有调控细胞生长和细胞周期的能力。

动物线粒体全基因组测序图


   线粒体基因组   

 

        线粒体拥有自身的遗传物质和遗传体系。通常而言,一个线粒体包含2~10份拷贝的线粒体 DNA(mtDNA)。动物 mtDNA 呈双链环状,其基因组大小介于 11~28 kb。以人类 mtDNA 为例,其长度为16,569 bp,包含 37 个基因(13 个蛋白编码基因、2个 rRNA 基因和 22 个 tRNA 基因)和 1 个非编码区(富含AT的控制区)。



动物线粒体全基因组测序


 

 

   线粒体基因组的应用   

 

    所有 mtDNA 以单体型进行遗传,几乎不发生基因重组,是生物学家研究物种群体遗传学和进化生物学的理想材料。相比于核基因组,mtDNA 拷贝数高,稳定性好,是考古学家和法医学家开展工作的重要对象。在医学领域,线粒体疾病是一种常见的遗传紊乱,医学科研工作者常利用 mtDNA 来研究、诊断及治疗线粒体疾病。

 

  如果获取线粒体基因组序列  

   传统方法   

 

     策略:根据参考基因组序列,设计简并引物,进行长距离 PCR 扩增,并采用一代测序方法获得 mtDNA 序列;

     缺点:项目周期长;无法确保获得全长 mtDNA 序列。


   主流方法   

 

     策略:分离获得线粒体细胞器,抽提线粒体基因组 DNA,采用高通量测序获得 mtDNA 序列;

     缺点:获得纯的线粒体细胞器费时费力。


   选择派森诺的优势在哪里?  

 

   

        客户仅需提供富含线粒体的组织、细胞或全基因组总 DNA,派森诺帮您获得线粒体 mtDNA 序列。


   经验丰富、周期短   

 

       派森诺在线粒体基因组测序服务方面经验丰富,已成功获得多个物种的线粒体 mtDNA 序列。从样品提供到获得线粒体 mtDNA 序列,仅需要 1 个月的时间,极大地提高了科研工作者的研究效率。


   分析内容丰富   

       

       提供拼接的 mtDNA 序列仅是我们优质服务的一小部分,除此之外,我们还提供包括注释、可视化、进化分析等等服务。


   注释高清   

        注 释(均以高清图片形式呈现,如以下注释内容和图片)


动物线粒体全基因组测序之tRNA 二级结构预测
tRNA 二级结构预测



mtDNA 拷贝数分析


动物线粒体全基因组测序之mtDNA 异质性分析

mtDNA 异质性分析


动物线粒体全基因组测序之mtDNA 突变分析

mtDNA 突变分析

动物线粒体全基因组测序之进化分析
进化分析