2015-10-30
甲基-茉莉酮酸酯为广泛存在于植物中的诱导因子，可促进茶叶中香味的挥发。已有对茶叶中各种挥发物成分的报道，但关于这些挥发物的生物合成途径的研究较少。
中国农业科学院茶叶研究所林智研究员和他的团队，通过转录组测序的方法，就不同甲基-茉莉酮酸酯处理时间的茶树叶片的基因表达差异进行研究，于2015年9月30日发表题为Transcriptional responses and flavor volatiles biosynthesis in methyl jasmonate-treated tea leaves的文章，文章发表在BMC Plant Biology（影响因子3.813）杂志上。
茶树叶片的转录组测序及信息分析工作，由上海派森诺生物科技有限公司完成。
研究流程
供试样本：茶树叶片
处理条件：甲基-茉莉酮酸酯处理，分别处理0h，12h，24h，48h
样本数量：4
分组信息：0h处理为对照，分别与不同时间的样本进行比较
测序平台：Illumina MiSeq测序平台
分析内容：KEGG注释、GO注释、聚类分析、qPCR验证等
实验结果
12h，24h和48h处理组分别检测到19245, 18614, 11890差异表达基因；α-亚麻酸降解途径应答茉莉酮酸酯途径，MEP/DOXP途径的基因表达发生显著变化；此外，类萜生物合成途径的相关基因与对照组相比也发生显著变化。
分析结果展示
甲基-茉莉酮酸酯处理后，Unigenes的差异表达分析（图1）
图1 基因表达聚类分析
Unigenes的基因功能注释（图2）
图2 基因功能注释（上）GO注释；（下）KEGG注释
qPCR检测靶标基因表达量，验证转录组测序的准确性（图3）
图3 qPCR验证
参考文献：
Jiang Shi et al. Transcriptional responsesand flavor volatiles biosynthesis in methyl jasmonate-treated tea leaves. BMC Plant Biology (2015) 15:233
本文由市场部王智健博士整理
