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Inzu手册昆虫触角转录组测序鉴定化学感受受体基因

2018-03-07

简介

柑橘星天牛(CLB)是中国的一种破坏性的本地害虫,和大多数昆虫一样,CLB利用嗅觉识别挥发性线索,调节一系列行为,包括交配,觅食,产卵和寻找寄主。昆虫的化学感受器包括气味受体(ORs),味觉受体(GRs)和离子型受体(IRs),用于将昆虫与其化学环境相连接。本文中作者通过NGS测序组装了星天牛的触角转录组,得到了44938个unigenes,并通过GO和和蛋白质正交基团簇(COG)注释了它们的假定基因功能,鉴定到来自化学感应受体基因家族的74个推定的受体基因(包括53个OR,17个GR和4个IR)。使用RT-qPCR对星天牛雄性和雌性的触角,上颌骨和唇须以及其余身体部分上的这些受体进行表达模式分析。结果表明,23个ORs,6个GRs和1个IR显示出雄性偏见的表达谱,表明它们可能在感知雌性产生的性信息素中起重要作用;而8个ORs,5个GRs和1个IR显示雌性偏倚表达谱,表明这些受体可能参与某些雌性特异性行为,如产卵部位寻找。这些结果为深入理解CLB嗅觉处理机制打下了坚实的基础,与他化学感受受体的比较研究结果也助于在CLB中鉴定额外的信息素和/或宿主引诱剂。

研究对象:柑橘长角甲虫雄性和雌性触角

测序平台:Hiseq 4000


1. Unigenes组装及GO和KEGG注释分析

从CLB触角转录组中获得了89,311个转录本并从中筛选出44,938个unigenes。blast同源性分析显示与赤拟谷盗T. castaneum(55.6%)的具有最佳匹配,包括嗅觉基因的相当一部分基因可从从基因组数据中鉴定到。

GO和KO注释展示了一些最具代表性的子类别:结合是分子功能类别中最丰富的子类别,而信号转导是环境信息处理途径中最丰富的。这些unigenes可能在触角化学感受过程中的气味结合和转导活动中发挥重要作用。


图一 GO和KEGG功能注释


2. 假定化学感应受体基因的鉴定

嗅觉受体:CLB样本的转录组分析发现了53个假定的OR。其中,11个序列含有全长ORF,5个基因(AchiOR1AchiOR24AchiOR32AchiOR43AchiOR44)含有7个跨膜结构域。作者发现了一个OR基因(AchiOR1),与保守的其他昆虫Orco基因家族具有高度同源性,并将其命名为AchiOrco。52个假定的OR序列分为四个亚组(第1-3和7组),其中19个序列分配给第1组,18个序列分配到第2组,10个序列分配到第3组,5个序列分配到第7组。第7组进一步分为两组:第7a组和第7b组。剩余的三个亚组4-6仅包含T. castaneum序列。此外,6个序列(AchiOR22AchiOR23AchiOR26AchiOR32AchiOR34AchiOR44)与来自M.caryae的信息素受体具有高度直系同源性。


 

图二 嗅觉受体基因系统进化树


味觉受体:生物信息学分析在CLB触角转录组中鉴定了17个假定的GRs。将来自星天牛的GR蛋白质序列和另外7种昆虫的用于构建系统发育树(图三)。在系统发育树中,基因分为“糖”,“果糖”,“苦”和“二氧化碳”GR功能。AchiGR1与已知的糖受体高度同源,AchiGR9与新型果糖糖受体高度同源,AchiGR6AchiGR15与已知的苦味受体高度同源,AchiGR7与已知的二氧化碳受体高度同源。

图三 假定的味觉受体基因系统进化树


离子型受体:在合并的触角转录组中鉴定了四个假定的IRs。其中,IR基因AchiIR2AchiIR3具有全长ORF,并且IR基因AchiIR4是唯一没有跨膜结构域的。根据对8种鞘翅目和黑腹果蝇物种的IR进行系统发育分析(图四),可将IR基因分为不同的亚组。AchiIR2DponIR76bDmelIR76b以高百分比同一性聚集,表明它属于IR76b组。此外,系统发育树将AchiIR3归入IR25a共同受体。

图四 离子型受体基因系统进化树


3. 假定的化学感受受体的组织和性别特异性表达

作者使用RT-qPCR确定了CLB触角,上颌触须,唇侧触及其余昆虫体内化学感应受体(53个OR,17个GR,4个IR)的表达模式。 41个假定的OR基因在大肠杆菌中表达

其中AchiOR2等8 OR序列的触角表达显着雌性化,AchiOR1等23个OR序列的触角表达显着偏向雄性,AchiOR7等10 OR序列在雌性和雄性触角中以相同或相似的水平表达。另外,AchiOR49在上颌骨中高度表达。AchiOR20AchiOR28AchiOR30AchiOR47在雌性身体中的表达水平显着较高。最后,AchiOR41在两性的唇侧触高度表达。

17个GR基因中的11个在触角中表达显着更高的表达(图6)。 5个GRs(AchiGR5-6AchiGR9AchiGR14-15)的5个突变体表达显着偏向雌性,其余6个GR(AchiGR3AchiGR7-8AchiGR10AchiGR12AchiGR17)的触角表达显着偏向于雄性。AchiGR2在雌性唇侧的表达显着高于任何其他组织,而AchiGR13在雌性身体中表达最高。AchiGR11在雄性唇侧和雌性身体中高度表达。在所鉴定的四种IR中,AchiIR2在雌性触角中表达最高,而AchiIR4主要在雄性触角中表达,AchiIR1AchiIR3在所有检测的组织中显示出相似的表达水平。



文献:

Sun L, Zhang YN, Qian JL ,et al.Identification and Expression Patterns of Anoplophorachinensis (Forster) Chemosensory Receptor Genes from the Antennal Transcriptome. Front Physiol. 2018 Feb 13;9:90.