2018-12-04
文案 | 转录调控事业部
转录因子（Transcription factor，TF）也称反式作用因子，是能够直接或间接与基因的顺式作用元件和RNA聚合酶结合以调控基因表达的一组双链DNA结合蛋白。
图1 转录因子主要结构
真核生物的RNA聚合酶不能直接识别启动子，需要通过多个转录因子间接与DNA结合，形成专一复合物转录相应的基因。转录因子通过与基因5`端上游特定序列专一性结合，从而保证目的基因以特定的强度、时间、空间进行表达。
图2：转录起始前复合物
转录因子的研究已经成为生物学领域研究热点，不管是人类和动物的重大疾病，还是植物的抗病抗逆，都与转录因子息息相关。
下面与大家分享一些转录因子数据库，帮助我们实现转录因子的查找，结构预测，结合位点以及靶基因预测等需求。
植物转录因子数据库
http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/
http://plntfdb.bio.uni-potsdam.de/v2.0/
拟南芥转库因子数据库
http://urgv.evry.inra.fr/CATdb
动物转录因子数据库
http://bioinfo.life.hust.edu.cn/AnimalTFDB#!/species
人与鼠转录因子数据库
http://hocomoco11.autosome.ru/mouse/mono?full=fals
预测转录因子结合位点数据库
JASPAR: http://jaspar.genereg.net/
PROMO: http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin/promo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.3
Matinspector:http://www.genomatix.de/online_help/help_matinspector/matinspector_help.html
转录因子靶基因预测数据库
MEME：http://meme-suite.org/tools/fimo
hTFtarget database：http://bioinfo.life.hust.edu.cn/hTFtarget#!/
有这些强大的数据库助力，要做转录因子研究的你，不妨试一试，发掘它们的强大功能吧！
