2018-12-18
前不久，测序公司Pacific Biosciences宣布Sequel平台推出升级版的系统软件（V6.0），以及新的试剂（V3.0）和SMRT Cell（1M v3）。为客户带来更长读长和更高准确性的序列解读，同时使得Pacbio Sequel在de novo测序、结构变异检测及全长转录组测序等方面的应用更具优势。
PacBio公司的CEO Michael Hunkapiller博士说：“客户现在可以通过长读长测序和高度准确的单分子reads的新模式享受新的功能。此外，许多用户不再需要在读长和准确度之间进行权衡，因为它现在可以带来长达15 kb的与Sanger质量相当的序列”。
派森诺基于新版本试剂和软件(软件V6.0、试剂V3.0)，在基因组和转录组层面进行测试，产出和读长均得到了很大提升。
实测数据统计
基因组项目
在某动物中同时用软件V6.0、试剂V3.0和软件V5.1、试剂V2.1进行基因组测序，数据对比如下，可以看出新升级后的试剂V3.0总产出是V2.1产出的两倍左右，平均酶读长一倍多。
表1：基因组中V3.0试剂和V2.1试剂数据比较
试剂版本 | 每个SMRT Cell产量(Gb) | 平均酶读长(Kb) | 最长read(Kb) | Subreads Read N50(Kb) |
V3.0 | 18 | 23.9 | 130.226 | 36.554 |
V2.1 | 9.1 | 17.4 | 93.234 | 29.234 |
全长转录组项目
在某一植物中同样用软件V6.0、试剂V3.0和软件V5.1、试剂V2.1进行全长转录组测序，数据对比如下，可以看出新升级后的试剂V3.0，运行20小时总产出是V2.1，运行10小时产出的近四倍，平均酶读长三倍多。
表2 V3.0和V2.1转录组测序数据统计
试剂版本 | 每个SMRT Cell产量(Gb) | 平均酶读长(Kb) | Subread 产出(Gb) | Subreads Read N50(Kb) |
V3.0,20h | 43Gb | 65.9Kb | 8.9Gb | 8.5Kb |
V2.1,10h | 12.3 Gb | 18,7Kb | 30Gb | 9.7Kb |
PacBio Sequel测序平台的优异表现，可让科研人员获得周期更短、质量更好的项目体验。派森诺生物自引进PacBio Sequel以来，平台运行持续保持“通量高、周期短”的平稳状态，已获得越来越多科研客户的认可，目前我司软件试剂版本均已升级，欢迎各位老师咨询。
