2019-01-22
多组学（Multi-omics）研究是探究生物系统中多种物质之间相互作用的方法，包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组学等，这些物质共同影响生命系统的表型、性状等。随着高通量测序技术的发展，组学（Omics）研究不断深入，通过对各组学进行高通量测序并对数据整合研究，可以全面和系统地了解基础研究、分子育种、临床诊断和药物研发等领域中多种物质的相互关系。为网络生物学、系统生物学的研究提供重要的技术手段。
为便于对多组学研究思路的理解，我们将近期发表的多组学文章进行整理。
1 、Clinical cancer genomic profiling by three-platform sequencing of whole genome, whole exome and transcriptome
基因组、外显子组、转录组测序在临床癌症基因组学中的研究
期刊：Nature Communications
影响因子：12.353
发表时间：2018
研究思路：对78例临床肿瘤样本，通过基因组、外显子组、转录组测序，对基因结构进行研究，找到与肿瘤相关的结构变异（structure variation,SV）、体细胞突变、致病性突变等。
2 、Omics and multi-omics approaches to study the biosynthesis of secondary metabolites in microorganisms
微生物次生代谢产物生物合成的多组学研究
期刊：Current Opinion in Microbiology
影响因子：6.710
发表时间：2018
研究思路：利用基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的方法，开发天然代谢产物。基因组学，挖掘天然产物的生物合成基因；转录组学，代谢通路分析；蛋白质组学，代谢通路分析；代谢组学，代谢通路分析、天然产物新家族的发现。具体研究思路见下图。
3 、Multi-omics approaches to disease
疾病的多组学研究方法
期刊：Genome Biology
影响因子：13.214
发表时间：2017
研究思路：本文为综述类文章，阐述多组学在疾病中的研究思路，包括基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、微生物组学的整合及各组学的相互关系。除基因组外，其它的组学都反映了遗传调控和环境的关系，这可能在不同程度上影响到每个组学的特定物质。各组之间会频繁发生交互作用。此外，利用多组学研究，可对GWAS突变进行优先级排序。
以上是通过发表的文献对多组学整合研究思路的梳理。后续，我们将陆续推出多组学研究案例的解读，敬请期待。
