2019-06-25
文案 | 转录调控事业部
转录组测序作为研究基因表达的利器，已成为分子生物学研究领域常用的重要技术，转录组测序通过对mRNA反转录形成的cDNA进行测序从而分析基因表达量，为了使cDNA浓度达到上机测序要求，我们需要对cDNA片段进行扩增。由于PCR扩增具有偏好性，不同的cDNA片段被放大的倍数不均一，再加上测序过程中有些片段会被过度扩增，这能够使我们了解基因表达大体趋势，但是无法满足对基因原始表达量的绝对定量。
派森诺生物推出超低RNA起始量的绝对定量转录组测序，将在cDNA扩增前，为所有cDNA片段添加上特异标签-UMI（Unique Molecular Identifiers），通过计算与cDNA相连的UMI个数，就能准确获得原始的cDNA数量，实现基因表达的准确定量。
UMI绝对定量实验原理
绝对定量转录组优势
▶ RNA起始量低，更适合量少与珍贵样品
▶ 基因表达水平的准确定量，避免低丰度基因丢失
▶ 准确定量动植物中寄生菌的转录本
▶ 可区分天然重复与扩增重复，准确识别可变剪切事件
▶ 校正扩增过程中出现的碱基错误，使RNA编辑分析更为准确
我们拥有10年高通量测序经验，完善的测序平台，强大分数据处理服务器，经验丰富的实验、技术与生信团队，为您提供“售前咨询→样品提取→文库构建→上机测序→数据分析→技术答疑”一整套连续的服务，为您的科研工作保驾护航。
参考文献
1. Boone M, De Koker A, Callewaert N. Capturing the 'ome': the expanding molecular toolbox for RNA and DNA library construction. Nucleic Acids Res. 2018;46(6):2701–2721.
2. Smith T, Heger A, Sudbery I. UMI-tools: modeling sequencing errors in Unique Molecular Identifiers to improve quantification accuracy. Genome Res. 2017;27(3):491–499.
3. Emanuel G, Moffitt JR, Zhuang X. High-throughput, image-based screening of pooled genetic-variant libraries. Nat Methods. 2017;14(12):1159–1162.
4. Saiful Islam, et al. Quantitative single-cell RNA-seq with unique molecular identifiers. Nature Methods. 2014, 11:163-166.
5. Kivioja T, et al. Counting absolute numbers of molecules using unique molecular identifiers. Nat Methods. 2011, 9(1):72-4.
