2019-07-08
Illumina 公司推出的NovaSeq 6000 SP芯片,其更高的测序通量及更短的测序周期都使得它能够在众多测序平台中脱颖而出,尤其是PE250测序策略的推出,让我们在扩增子测序领域中看到了更广阔的前景!
派森诺依靠强大的技术研发实力,和开拓进取的精神,目前已经实现了菌群多样性组成谱项目的NovaSeq SP芯片PE250测序!接下来小编按捺不住激动的心情,向大家展示派森诺NovaSeq SP芯片PE250实测数据及分析结果,让我们一睹为快吧~
本次数据与MiSeq PE250数据进行对比,总结为以下几点:
1
NovaSeq细菌16S rRNA基因碱基质量分布图
NovaSeq真菌ITS1基因碱基质量分布图
细菌16S rRNA基因与真菌ITS1基因NovaSeq测序质量表格
从以上数据图表可以发现,NovaSeq PE250测序数据通量和质量都高出一大截,碱基质量Q30平均可以达到90%以上,远高出官方提供标准,数据利用率进一步提升;
2
MiSeq与NovaSeq细菌16S rRNA基因门和属水平物种相对丰度柱形图
MiSeq与NovaSeq真菌ITS1基因门和属水平物种相对丰度柱形图
无论是细菌还是真菌测序分析结果,都可以看出,两种测序平台得到的物种组成及丰度分布保持高度一致,优势物种分布无差别;
MiSeq与NovaSeq稀有物种(<0.1%)数量对比
在随机挑选的8个样品中,我们针对样品中属水平上的稀有物种(即相对丰度低于0.1%)进行了数量统计,结果显示,NovaSeq测序得到的结果能获得更多的稀有物种,这对于我们研究关键物种意义重大,也展现了NovaSeq测序平台更大数据规模测序的优势!
4
MiSeq与NovaSeq的Procrustes一致性比较分析
同时,Beta多样性Procrustes一致性分析结果显示,两种测序平台的同一样品物种组成及丰度分布基本一致,且高度相关。
上述结果表明,作为Illumina测序系统中的“新贵”,NovaSeq平台不仅能获得和MiSeq平台高度一致的菌群组成结构,而且在测序质量上,也相比Q30>75%的MiSeq、NovaSeq PE250模式官方质控标准,有大幅提升!更重要的是,在NovaSeq平台上,能轻而易举的实现大样品量、高测序量的菌群多样性组成谱解析,对于低丰度物种的探测、以及菌群整体组成的分辨率也将更精细!
派森诺也将一如既往地秉承“解析基因序列,诠释生命密码,改善人类生活”的使命,始终贯彻“枝源派本,一诺千金”的服务宗旨,继续为大家带来科研技术服务!