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转录组测序技术的优化版,心动了吗?

2019-10-29


转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,主要包括 mRNA和非编码RNA。为了解决更多的科研问题,测序平台与测序技术都处在不断优化的过程中,转录组测序技术也不例外。

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由于PCR偏好性等客观因素的影响,常规转录组测序的基因表达定量会受到影响。绝对定量转录组测序技术解决了扩增重复问题,在cDNA文库扩增前对每一个cDNA片段加上特异序列标签(UMI),该标签会随cDNA序列一起扩增测序,即来自于PCR扩增的序列会与原始序列带有相同的UMI,通过过滤带有相同UMI的重复序列还原RNA文库中最原始的RNA表达量,在组间基因表达相对定量的基础上实现绝对定量。

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项目流程图

 

跟常规转录组测序项目相比,绝对定量转录组测序技术在实验环节多了一步UMI的添加,在分析环节多了一步UMI数据过滤与统计,其余的分析内容和常规转录组一样哦!派森诺生物在不久之前做了分析内容的全面升级,努力做到人无我有,人有我优,老师们提出的个性化分析需求我们也会全力解决!

 

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部分分析内容展示1

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部分分析内容展示2

 

绝对定量转录组测序技术优势:

1、基因表达的精准定量。通过特异标签去除扩增重复与测序重复,解决偏好性问题。

2、更精准的碱基识别。带有相同UMI的序列来自于同一条转录本,序列间相互校正获得精准的序列信息。使SNP等结构分析结果更准确,对于无参考基因组的转录组测序尤为重要,精准的碱基识别可大大提高unigene拼接的正确性。

3、建库所需RNA量低于常规转录组。

 

要做转录组测序的你,请想一个不选绝对定量转录组测序的理由~

 

2019年1029

转录调控产品部