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转录组干货技巧大总结,收藏一篇就够了!

2020-03-07


收藏的文章太多,之前看到的文章找不到了怎么办!?收藏这一篇就够了!


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抗疫时期,

全民宅家变大厨,

科研学习也不能落后!

是时候该掌握真正的技术了!


转录组测序(RNA-seq)作为当下最有效的从整体水平上研究细胞基因表达情况及转录调控规律的技术之一,在现在的科研项目中已经越来越常见了。可是听过那么多讲座,看了那么多文献,依然搞不懂转录组研究项目的“套路”?对于一些常见的转录组数据分析技巧还云里雾里?为了解决大家在这方面的困惑,我们把之前推送过的一些转录组技巧类的文章进行汇总,从做项目前期找参考基因组,到后续做功能验证给您详细的指导。

做转录组项目前期

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干货 | 如何确定物种是否有参考基因组(一)

干货 | 如何确定物种是否有参考基因组?(二)

研究的物种是否有参考基因组是做转录组测序之前首先要确认的一个问题,这决定了我们是做有参转录组测序还是无参转录组测序。不同的项目对应的分析方法不同,在这两篇文章里给大家详细的介绍了如何在一些主流数据库(Ensembl数据库、NCBI数据库)找参考基因组和一些特殊物种的数据库(UCSC数据库、JGI基因组数据库、柑橘类基因组数据库、 蔷薇科基因组数据库等)找参考基因组。


拿到测序结果时

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转录组测序结题报告怎么看?点进来就知道啦!

很多不了解RNA-Seq的小伙伴,在点开结题报告的一瞬间,满脑子的问号。这篇文章可以让您快速了解转录组测序结果的三大部分,着重关注重点分析内容。

转录组结果如何挖掘关键基因——你不得不知的“套路”

看懂结果是解读数据的第一步,如何把结果和最终的课题相关联,这篇文章教您如何挖掘关键基因。

干货 | EXCEL小技巧助力转录组数据挖掘

您找到关键基因后,怎么把它们对应的表达量,差异结果和注释信息放在一张表里呢?

这篇文章为您介绍了EXCEL的VLOOKUP函数,轻轻松松帮您把所有的信息整理在一起。

干货 | 如何查找目标基因序列?掌握这几招就够了!(NCBI篇)

干货 | 如何查找目标基因序列?掌握这几招就够了!(Ensembl篇)

针对有参考基因组项目,当您最终确定了目标基因,准备设计引物进行qPCR验证或者后续的基因功能实验时,这两篇文章就为您介绍了如何在NCBI和Ensembl数据库里查找目标基因的序列。


做完转录组项目后

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新版测序数据上传NCBI教程

做完测序工作,数据分析和文章撰写,但是在文章发表前往往都需要上传数据。那么数据上传到哪里?怎么进行数据的上传?这篇软文就帮大家梳理了这些问题,从此数据上传So easy~

转录组结果,你的qPCR为啥验证不上?

转录组结果出来后往往都会做qPCR验证,但有的时候结果验证不上很让人苦恼,这篇文章就为大家详细的分析了出现验证不上的几种原因。

多种验证方法,助力发表高分文章!

那么除了qPCR,对于转录组测序后的其他验证方法,这篇文章也有详细的介绍。

以上就是我们在去年发表的一些技术类文章的总结,接下来我们也会接着发表更多的干货类软文,助您科研成功是我们的职责,让更多客户满意是我们的追求!如您有任何想要了解的转录组知识,也欢迎您在下方的评论区留言,我们会结合大家的建议,发表更贴近大家需求的干货文章。