2020-03-12
代谢组学 (Metabolomics)，是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。代谢组学研究是利用液质联用/气质联用技术研究在某一时刻样本内所有代谢物。代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化, 反映了机体系统的生理和病理状态。
做代谢组学是选择非靶向代谢组还是靶向代谢组学？这是被问过很多次的问题。
非靶向代谢组学：又被称为发现代谢组学，是对生物样本的整个代谢组进行全面的代谢物鉴定与分析，意在系统的发现不同样本中的代谢物质差异情况。非靶向代谢组学能够最大程度上体现生物样品体系中总的代谢物信息，尽可能地去定性和定量（相对）所有的代谢物。对不同处理或生理状态的样本代谢产物进行检测，可以获得不同状态之间的差异代谢产物，从而探究差异机制，寻找生物标志物，可用于植物抗逆，植物营养和药用价值评价，人和动物疾病治疗，微生物与发酵工程等领域。
靶向代谢组学：即有目标代谢物质群，需要代谢物质对应的标准品为参照，对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。靶向代谢组学包含不同的细分产品，如短链脂肪酸靶向检测、氨基酸靶向检测、有机酸代谢靶向检测、神经递质类物质靶向检测，动/植物激素靶向检测等等。靶向代谢组分析具有特异性强，检测灵敏度高和定量准确等几个特点。通过对样本中某一特定的代谢物的富集与准确定量定性分析，一方面可以结合其它实验数据揭示相关的分子生物学作用机制，另一方面，也可以为后续代谢分子标志物的深入研究和开发利用提供有力支持。靶向代谢组学可以用于验证有非靶向代谢组学实验提出的假说：也可以进行基于假说的探索性实验（通常根据 最新的解释），针对特定代谢物， 研究代谢模型。
当没有特定关注的代谢物质，想利用代谢组学做差异代谢物质广筛的这类基础研究的时候推荐选择非靶向代谢组学，例如，做了转录组、蛋白组学研究，想与代谢组数据进行多组学关联分析。
当做代谢组检测之前，就已经通过一定的实验方法或者测序手段发掘了目标表型或者代谢通路，可以锁定目标代谢物类型的时候推荐选择相应的靶向代谢组学检测，比如，研究精神类疾病时可以选择神经递质靶向代谢检测，研究生殖相关的课题可以考虑动物激素靶向代谢检测等等。需要注意一点，并不是所有类别的代谢物都有成熟的靶向检测项目，目前能靶向检测的代谢物质都是科研人员使用标准品基于各类质谱平台检测慢慢积累下来的。
下面这段话也需要特别注意：
很多老师关注的某一类或者某几个代谢物质并没有对应的靶向检测项目，怎么办呢？这时候就需要评估可行性了，评估手段包括查阅国内外文献，是否有标准品，综合已经具备的检测条件等等一系列因素来确认是否可以顺利进行。
除了以上提到的非靶向以及靶向代谢组学之外，还有脂质组学产品，可以针对8大类脂质类物质进行检测分析，包括脂肪酸类、甘油脂类、甘油磷脂类、鞘脂类、固醇脂类、孕烯醇酮脂类、糖脂类、多聚乙烯类。
最后，对今天的主题做个总结对比
友情提示：做代谢组学检测一定要有足够的生物学重复，代谢物个体差异较大，生物学重复数不足面临审稿专家质疑风险会很大哦。
生物学重复数目建议：
植物：6（3）
动物、人：10（6）
临床样品：推荐30个。
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