2020-06-19
降解组测序是利用高通量测序平台批量鉴定miRNA真实靶基因的技术，miRNA通常起到抑制或降解mRNA的作用，从而影响基因功能的发挥。
寻找miRNA靶基因的常规手段最常见的有两类，一类是生信手段：基于序列信息通过Target Scan、miRanda等软件预测。一个miRNA可以靶向多个mRNA，一个mRNA也可以被多个miRNA靶向结合，所以通过生信预测出来的结果信息量会很庞大，且假阳性高，需要在海量的靶向关系中找到关键基因来做实验验证。另一类是实验手段：如利用AGO蛋白做RIP（RNA免疫共沉淀），以及CLIP、生物素下拉等方法。实验方法一般操作复杂，依赖抗体与试剂的好坏与质量，且人为操作过程中影响因素太多，除了这些外界因素外，还受抗体特异性、交联效率，背景噪音等因素影响，属实有点费力不一定讨好的样子。
降解组测序可以同时解决上述手段存在的问题。通量高，结果准，不需要做复杂的实验。且降解组测序不需要生物学重复，如果同时做转录组或者Small RNA测序，每个组的生物学重复混成一份样品做降解组测序就行啦！
技术流程
miRNA在mRNA上剪切位点t-plot图
降解组一般都是结合转录组以及小RNA测序数据一起阐明基因表达调控机制，早做早发文章哦~
