2020-08-06
在“与DNA提取有关的那些事（一）（点击查看）”文章中，我们简单介绍了DNA提取原则和原理等。
但由于自然界物种丰富，老师们研究物种的组织部位、生理生化特性各异，进而增加了DNA提取的难度。糖类、酚类、蛋白、油脂、次生代谢物等都会影响DNA的得率和完整性。
今天我们就目前遇到的部分困难样本展开简短的总结和结果展示。
一、不同类型难提取样本特点分析
二、几种难提取样本案例展示
1.蔷薇科植物、真菌
主要问题：多糖、多酚、多次生代谢物。
改良方案：公司拥有发明专利的“多糖多酚植物基因组的提取方法”，能有效去除多糖多酚、得到高纯度高质量的DNA。利用改良真菌CTAB法，对不同物种的真菌提取会更有针对性、效率更高。
提取结果：(使用多糖多酚提取法进行提取，并对8、14号样本进行针对性优化）
图1 秋海棠科不同物种提取结果
图2 针对特殊物种进行再次优化
图3 多次生代谢物真菌（攀枝花白块菌）
2.太岁
主要问题：是由粘菌、细菌和真菌三类菌构成的一种稀有的聚合体，研究成果较少。样本取样部位不确定，杂质多，得率低。
改良方案：实验室针对已知物种特性，以沉淀法为基础，通过多次改良，总结出一种适用于太岁的特殊提取法，有效的提高了DNA的质量。
提取结果：
图4 太岁优化前后对比
3.孢子、坚强芽孢杆菌等
主要问题：细胞壁由一层较厚(10-50nm)的含胞壁酸的肽聚糖构成，一般方法不易破壁，得率低，易降解。
改良方案：选择合适的研磨条件，加大裂解力度，添加辅助破壁的酶类试剂。
提取结果：
图5 两种厚壁物种CTAB法提取结果
图6 两种厚壁物种改良CTAB法提取结果
4.小型昆虫
主要问题：个体小，角质较丰富、组织萎缩较严重。
改良方案：实验室有相对应的昆虫组织提取法。
提取结果：
图7 不同物种、不同保存方式提取结果
5.水母
主要问题：身体主要成分是水，有很厚的中胶层，部分物种还含有大量的蛋白质，核酸含量较低。
改良方案：实验室对原有CTAB法进行了针对性的优化，增加了对样品的前处理，效果明显。
提取结果：
图8 一种霞水母科普通提取（左）和优化后（右）结果
以上为大家列举了派森诺实验室对几种困难样本的改良结果。在多糖菌类、微量样本、发酵样本、非常见物种等方面，也创新出了很多高效的针对性方法，就不一一给大家列举了。
希望我们方法的多样性及灵活性能给您的科研项目带来帮助~~
