2020-11-06
在前几期微生物组的问答集锦中，已经详细介绍过QIIME 2、QZV（Qiime Zipped Visual）文件、以及派森诺微生物组基因云，想必大家对它们都不陌生啦~
在上期介绍中，我们讲解了QIIME 2进行物种注释的方法。根据注释结果，就可以整理物种组成的数据，对结果进行分析啦~曾几何时，您是否在查看物种组成分析的结果时，会对Other里的内容充满好奇？又是否在整理各分类水平的图表时，心烦意乱？
不要怕！这些问题，都可以通过QIIME 2专属的QZV文件，为您达成！今天小编就带领大家，从物种组成分析环节，近距离体验QZV，一看就会，一点就通！
一、找到用于可视化的QZV文件
1、通过网盘下载获取数据的项目：
Treat*\2.2.2_taxa_summary中grouped及ungrouped（QIIME2版本）
2、通过“派森诺基因云（https://www.genescloud.cn）”获取的项目：
在物种组成分析 / 分类学组成分析 / 右上方的QZV链接中下载ungrouped的qzv文件：
也可以在分析设置中选择“组内平均值”，点击运行之后下载grouped的qzv文件：
二、打开QZV可视化网站https://view.qiime2.cn/，可以看到如下界面：
三、将下载的QZV文件拖拽至上方灰色方框
到这儿，QZV文件的可视化算是告一段落~But！功能远不止于此！
通过柱状图，既可以体现每个样本不同分类水平下的物种组成，也可以展现组内物种结构以及组间物种丰度的变化趋势。接下来，小编就为大家作具体展示~
1、通过Download模块可以轻松获取当下视角svg格式的图以及当下分类水平物种的绝对丰度表；滑动Bar可以任意调节柱子宽度。
2、在Taxonomic Level模块可以调节不同分类水平（L1-L7，界门纲目科属种），查看各样本的全部物种组成情况，每种颜色代表一个物种；在鼠标悬停至不同颜色或不同样本的柱子时，可以查看相对丰度数据。此外，当鼠标点击右侧的物种对应的颜色时，可以比较不同样本同一物种的丰度数据。
3、 Color Palette模块可以对柱子的颜色进行调节；Sort Sample模块可以改变样本的排列及展现方式，比如根据样本名称、分组情况或者按照某个物种丰度的升序（Ascending）或降序（Descending）进行排序。
以上就是今天给大家介绍的物种组成QZV可视化方式了，大家可以进入基因云下载尝试哦~如有操作问题，也欢迎讨论区留言或者发邮件给小编哟（邮箱地址：metasupport@personalbio.cn）！
