2020-12-23
派森诺基因云9月份上线了真核有参转录组云分析(【派森诺基因云】有参转录组交互分析系统开学开启,一键解锁精准分析!点击查看),12月份又上线了一系列小工具(12月的第一批高效精美作图小工具热血上线,你get了吗?点击查看) ,为了让广大用户有更好的分析体验,云分析和小工具也在不断升级,今天就来一起看看基因云的新面貌!
一、根据内部使用和用户反馈,转录组云分析进行了几大板块的更新:
1、项目概况部分-在界面添加参考基因组的注释表格的下载:
2、表达差异分析-差异基因韦恩图-分析设置增加了可以自由选择比较组的功能,大家可以根据自己的需求自行绘制需要的venn图:
3、表达差异分析-聚类分析,热图开发了优化版,可以直接在图表调整部分,调整配色,图片高度,聚类方式,图例和标签大小等,参数确定后,点击下方“更新绘图”按钮,一键更新,即时获取新热图:
二、为了更好的提供个性化的补充分析,云图汇增加了转录组相关适用工具:
1、交互相关系数图-想要单独对已有的表达量的数据表格自行进行相关性分析,可以选择“交互相关系数图”,根据示例提交数据后,点击“提交绘图”,即可在“图表调整”区域进行颜色,聚类方式,方法,图例等调整:
2、交互火山图-想要对自己整理的数据,有倍数,有p值,单独拿来进行绘制火山图,可以选择“交互火山图”,按照示例上传文档后,点击“提交绘图”,即可在“图表调整”区域进行颜色,点大小,倍数,p值范围,图例等的调整:
3、热图或者是交互热图-想要对筛选得到的目的基因进行热图的绘制,可以选择“热图”或者“交互热图”,按照示例上传文档后,点击“提交绘图”,即可在“图表调整”区域进行颜色,数据处理方法,图例等的调整,点击“更新绘图“即可获得新的结果:
4、GO富集分析或者KEGG富集分析-要对筛选得到的目的基因进行富集分析的绘制,基因功能富集可以选择“GO富集分析”,代谢通路富集可以选择“KEGG富集分析”,按照示例上传文档后(KEGG富集分析还需要选择物种),点击“提交绘图”,之后点击右上方“结果查看”按钮进入分析进程页面,显示分析完成后,即可点击进入结果查看,此时可以在“图表调整”区域进行颜色,图表展示形式,图例等的调整:
常规分析,云分析可以一网打尽;目的基因的挖掘后的热图到富集分析,云图汇可以一一实现。快来点击注册派森诺基因云(https://www.genescloud.cn/),自由玩转转录组分析吧!