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C位出道的单细胞测序技术,到底有多闪耀

2021-03-01


单细胞测序就是获取单个细胞遗传信息的测序技术。到了2021年,单细胞转录组测序以一骑绝尘的速度迅速俘获研究者的芳心,成为科学研究领域的新宠。下图展示的是10Xgenomics各产品累计发表文章数目。

2020年推向市场的空间转录组测序技术,荣获2020年nature methods推荐技术,相信在不久的将来,会在众多产品中脱颖而出。


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数据来源:10Xgenomics 官网 https://www.10xgenomics.com/resources/publications

图片编辑:派森诺基因云 https://www.genescloud.cn/home


单细胞测序技术为什么能发展如此迅猛?这要从它的原理说起。

单细胞测序技术利用微流控系统对组织中的每一个细胞加上标签,将同一个样本的所有细胞pool在一起测序,一方面获得了单个细胞转录组的分辨率,另一方面将单细胞测序成本降到最低,达到了高分辨率、高通量、低成本的特点,而它的这一特点,将助力其获得更广阔的舞台。

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单细胞测序适用于哪些领域?概括而言,细胞异质性程度高的生物学过程,都是单细胞测序发挥中流砥柱作用的过程。具体包括肿瘤微环境、免疫图谱、胚胎和器官的发育以及神经发育等等。

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数据来源:10Xgenomics 官网 https://www.10xgenomics.com/resources/publications

图片编辑:派森诺基因云 https://www.genescloud.cn/home


单细胞测序可以解决哪些生物学问题?单细胞测序能解决的问题非常非常多,小编在此整理了几个重要的方面,每个方面以一篇文章为例做简略的阐述。

1、绘制细胞图谱

发表杂志:Nature

发表时间:2020年3月

主要研究结论:对60种人体组织样品和7种细胞培养样品进行了单细胞测序分析,系统性地绘制了跨越胚胎和成年两个时期,涵盖八大系统的人类细胞图谱。

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2、解析疾病发病机制

发表杂志:cell

发表时间:2020年6月

主要研究结论:利用单细胞测序技术鉴定到一群肿瘤特异的细胞,并通过空间转录组技术分析了这群细胞特异性定位于肿瘤边缘,揭示这群细胞是细胞间通讯的枢纽,也是决定肿瘤扩展的关键细胞。

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3、揭示发育生物学过程

发表杂志:Cell

发表时间:2021年2月

主要研究结论:利用单细胞测序和空间转录组测序检测了小肠中5.3万多个细胞的基因表达,为了解炎症性肠病和食物过敏的生物学机制提供了丰富的参考资料。

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4、筛选诊断标记物

发表杂志:Cell Reports

发表时间:2019年5月

主要研究结论:利用单细胞测序构建了从胃炎到早期胃癌的单细胞转录图谱,鉴定了一组早期肿瘤细胞特异性标记基因,有助于早期胃癌的准确诊断。

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5、提出治疗方案

发表杂志:Cell

发表时间:2020年8月

主要研究结论:利用单细胞测序技术分析了PD-1抗体治疗、TREM2抗体治疗、PD-1抗体联合TREM2抗体治疗和抗体对照治疗后髓系细胞特征,论证TREM2表达与临床结果之间的相关性,提出了一种靶向肿瘤髓系细胞抗TREM2治疗的新方法。

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6、药物研发

发表杂志:Nature Communications

发表时间:2018年10月

主要研究结论:利用单细胞测序分析了433个药物化合物对细胞的基因表达差异,帮助检查相似的药理作用机制,促进新药研发。

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当然,小编提到的上述思路只是单细胞测序的冰山一角,她能给予我们的惊喜远远不止于此。想要了解单细胞测序的潜在应用,赶紧联系您身边的派森诺销售,获得派森诺的一对一个性化解决方案吧~