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派森诺讲解如何绘制好看的3D气泡图

2021-09-06

一、图表介绍

气泡图,顾名思义,就是以气泡形状为主绘制的图,它是一种多变量的图表,与散点图外观相似。但与散点图不同的是,气泡图除了可以用X、Y轴去表示变量值之外,每一个气泡的面积与颜色还可以表达第三和第四个维度的数据。

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我们先看两款大家常见的气泡图:


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From Daniel Min(Ref1)

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今天想给大家重点介绍的是下面这款具有3D效果的气泡图:

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图1 气泡图示例

二、平台实现

首先,登入派森诺基因云, 进入【云图汇→气泡图

1. 准备数据

准备图2所示数据,数据文件第一列对应的是组(可有可无),第二列对应的是样品名称,第三、四列对应的是变量数值。第五列对应的是气泡大小。

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图2  数据文件示例


2. 提交绘图

上传数据后,一键提交绘图即可。

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图3 提交数据绘图


3. 参数调整

1)着色模式:按照分组和按样品配色,另外用户根据我们提供的色卡,也可以自行配色。

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图4 图表颜色示例


(2)标签设置:可以控制标签显示与隐藏。

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图5  标签显示与隐藏示例

参考文献:

[1] Daniel Min et al.AXIOME3: Automation, eXtension, and Integration Of Microbial Ecology . GigaScience, 10, 2021, 1–4 doi: 10.1093/gigascience/giab006 


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