2021-12-23
值此双旦之际，特此和大家一起看看基因云平台，那些使用上万次的热图，都有哪些功能亮点呢？ 01、热图 1.1 简介 热图，通过着色的单元格展示多个样品之间的关系或相关性。 图1 热图示例 1.2 数据文件 第一列对应的是基因名称，其他列对应的是数值。 genename S1 S2 S3 S4 Gene1 5.119 1.407 5.607 1.82 Gene2 5.139 0.485 5.844 0.313 Gene3 3.802 1.824 6.419 2.449 Gene4 4.858 3.031 5.456 2.142 表1 热图数据示例 1.3 参数调整 功能亮点：可添加网格线，和显示数值。 图2 热图图表样式调整 02、交互热图 2.1 简介 前面的【热图】生成的图片是静态的，不能够实时动态的进行调整。这款交互热图，可以很方便的实现热图的实时调整。 图3 交互热图含分组示例 2.2 数据文件 热图和交互热图数据文件相同，交互热图多了个分组文件，因此能够支持分组数据的展示。 SampleName Group A1 A A2 A B1 B B2 B 表2 交互热图数据示例 2.3 参数调整 亮点一：基因名称随意选择显示：可随意选择基因/样品名称的显示与隐藏，当数据量大时，可以避免图表名称堆叠过于杂乱，轻松实现查看特定基因/样品的表达情况。 图4 交互热图基因名称示例 图5 交互热图显示/隐藏名称 亮点二：单元格随意缩放，在图表调整栏，我们可以根据需要，横向拖动随意调整单元格的宽度和高度。 图6 交互热图宽高示例 图7 交互热图宽高调整 03、关联热图 3.1 简介 对物种丰度和生化指标或影响因子之间进行相关性分析。 图8 关联热图示例 3.2 数据文件 第一列对应分类名称，其它列为样品对应的数据。 Taxon CK1 CK2 CK3 CK4 Cladosporium 0.04 0.07 0.01 0.002 Rachicladosporium 0 0 0 0.0005 Toxicocladosporium 0.005 0 0 0 Mycosphaerella 0.003 0 0 0 unidentified_Septoria 0 0 0 0 表3 关联热图数据文件示例 因子文件第一列为因子名称，其它列为样品对应的数据。 factor CK1 CK2 CK3 CK4 A1 pH 6.23 6.5 6.5 7.53 7.68 TN 2.48 2.24 1.9 2.23 2.11 MC 0.037 0.042 0.038 0.029 0.027 AP 190.02 191.99 190.02 39.53 32.46 表4 关联热图数据因子文件示例 3.3 参数调整 功能亮点：可以调整图形样式为圆形，热图，椭圆形等。还可以添加不同样式的显著性星标。 图9 关联热图图表调整 图10 关联热图参数调整 04、交互原值热图 4.1 简介 交互原值热图，显示原始数值的热力图。 图11 交互原值热图示例 4.2 数据文件 与热图数据格式一样。（第一列对应的是基因名称，其他列对应的是数值） 4.3 参数调整 功能亮点：可以绘制矩形热图和环形热图，一个基因数据，也可以绘出漂亮的图表。 图12 交互原值热图图表调整 05、交互日历图 5.1 简介 可以查看每月每天的数据分布情况。 图13交互日历图示例 5.2 数据文件 第一列对应的是时间，第二列对应的是数据。 Time Value 1/1/20 3 1/2/20 5 1/3/20 7 1/4/20 9 1/5/20 11 1/6/20 13 表5 交互日历图数据示例 5.3 参数调整 功能亮点一：图表类型随意切换， 可切换热图、散点图两种图表，热图图表通过色块区分数据，而散点图图表根据点的大小来区分。 图14 交互日历图示例 功能亮点二：可根据不同的数据，显示不同的图案。 图15 交互日历图示例 图16 交互日历图示例 06、交互六边形热图 6.1 简介 六边形热图（Hexagonal Heatmap）也称六边形分箱图（Hexagonal Binning），是一种由六边形为主要元素构成的统计图表。它既是散点图的延伸，又兼具直方图（频数统计）和热图（按值着色）的特征。 图17 六边形热图示例 6.2 数据文件 分别对应的是两列数值。 X Y 211 374 500 364 374 446 655 637 556 595 745 436 表6 六边形热图数据示例 6.3 参数调整 功能亮点：图形元素显示范围可通过色轴自由控制。 图18 六边形热图示例
更多新闻资讯，请关注派森诺官网
