2022-06-02
单细胞测序通过对组织内部每个细胞的转录组的解析,带领科学研究进入到高分辨率的领域,将生命科学研究从分子水平返璞归真到细胞和脏器水平,同时又依然保留分子水平的解析,为生命科学的发展注入新燃料。单细胞测序在多个领域都发挥了举足轻重的作用。今天,小编为大家介绍一下单细胞测序在药物研发中的应用。
药物研发总体而言包括四个阶段:确定研究疾病、靶点筛选和验证、先导化合物筛选和优化、临床实验等四个阶段。小编将在临床前研究的三个阶段分别以已发表的单细胞测序文献为切入点进行详细介绍。
一、研究疾病介绍
发表时间:2020年
影响因子:14.919
分析思路:
主要结果:
主要结论:
• 14例样本,捕获到70787个细胞
• 分析了T细胞,巨噬细胞,DC细胞的异质性
• TCR克隆型分析T细胞的发育谱系
• 免疫逃逸细胞的通讯分析
• ESCC的免疫逃逸机制分析
发表时间:2021年
影响因子:14.919
分析思路:
主要结果:
主要结论:
• 8例样本
• TAM高表达一系列免疫逃逸基因
• 通过TIGIT-NECTIN2抑制TIL
• 肿瘤内部和肿瘤之间均存在肿瘤异质性
• 肝癌的免疫逃逸机制解析
二、药物靶点筛选
发表时间:2019年
影响因子:53.440
分析思路:
主要结果:
主要结论:
• 85例样本的质谱流式鉴定到CD73Hi髓系细胞
• 4例GBM病例单细胞测序, CD73Hi 髓系细胞是GBM特有细胞
• 12例PD-1治疗前后单细胞测序, CD73Hi髓系细胞与预后相关
• CD73-/-小鼠验证CD73可作为免疫治疗新靶点
三、药效评估
发表时间:2018年
影响因子:41.582
分析思路:
主要结果:
不同治疗方案对T细胞的评估
不同治疗方案对髓系细胞细胞的评估
主要结论:
• ICT治疗前后淋巴系细胞差异,包括细胞数目、基因表达、信号通路三个层面的差异
• ICT治疗前后髓系细胞差异,包括细胞数目、基因表达、信号通路
• 拟时序分析鉴定髓系细胞起源
• 活化T细胞产生的IFNγ参与髓系细胞分化
结论
单细胞测序已然引起了学术界的变革,药企的新革命,也已悄悄降临。单细胞测序,助力药物研发迈向更准确、更便捷、更短周期。