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如何绘制漂亮的Circos图

2022-07-13

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在生信分析中,如何在染色体层面查看不同区域/基因的表达情况,差异显著性呢?能否有一个图能够通过不同的图表样式,展示P值、上下调表达差异、均值等不同类别数据特征呢?为了解决这个问题,派森诺基因云特此推出了“染色体Circos图”,耗时半月倾心制作,此图不仅颜值顶顶而且可调参数众多,快来随小编一探究竟~


一、图层设置


1.1图表绘制模式


每一圈层可以绘制不同图表类型,也可以绘制相同图表类型。


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默认绘制的四层图表分别是热图(常用于显示P值等数据)散点图(常用于显示上调倍数等数据)折线图(常用于显示上调倍数均值等数据)柱状图(常用于显示上调基因下调基因表达等数据),额外增加的两层分别是散点图柱状图,每个圈层均可切换以上四种图表类型。


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1.2热图图表调整


根据上传的数据,默认将第四列到最后一列所有value值当作热图数据作图,我们可以通过勾选列名来筛选实际热图数据作图,或选择热图数据中部分value值在图上显示。


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1.3柱状图宽度调整


根据上传的数据,我们会计算出最优的柱形宽度,可通过宽度系数按比例缩小柱形宽度;另外,也可指定上传数据中某一列为每个柱形设置具体宽度。提交绘图之后,点击项目列表的图标即可查看。



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二、背景着色方式


着色方式可分为:环形着色(单色着色模式),扇形着色(多色着色模式)。



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三、图表间距设置


既可以调整轨道(环形)与轨道之间的间距,也可以调整染色体(扇形)与染色体之间的间距。


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四、标签的显示


可以控制最外层标签以及刻度线是否显示,分别组合为以下4种模式


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赶紧来试一试吧,百度搜索“派森诺基因云”或者直接访问https://www.genescloud.cn/home,进入“云图汇”搜索“染色体Circos图”尝试体验,并提宝贵建议至平台消息中心-》反馈列表,或者发送到邮箱:gc_support@personalbio.cn。"派森诺基因云" 一直持续上心上新,接下来会有更多好图好工具陆续和大家见面,欢迎大家关注并进行体验。


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