2022-08-24
网络热图由热图和网络图组成,其中热图可展示组内的相关性,而网络图可展示组间的关联性。网络热图样式新颖,应用广泛,比如可以用于展示微生物丰度与环境因子之间的关联关系。接下来我们一起看看派森诺基因云如何实现网络热图的绘制。
一、图形解读 …… 热图:展示各环境因子之间的相关性。 网络图:展示微生物丰度数据与环境因子之间的关联关系。
二、数据准备和提交 …… 2.1 数据格式 网络热图需要提供丰度数据文件和因子文件。丰度数据文件至少为两列,第一列为样本名,其它列为丰度数据。因子文件至少为三列,第一列为样本名,其它列为因子数据。
2.2 提交绘图 首先登录「派森诺基因云」,将准备好的丰度数据和因子文件上传,然后点击提交绘图。绘图完成后点击刷新按钮,即可刷新任务状态,任务完成之后就可查看最新结果图啦。
三、热图部分功能介绍 …… 3.1 热图位置 可调整热图位置为左上角或右下角。
3.2 相关性表示 可使用格子颜色+大小或仅以颜色来表示相关性。热图颜色越深、格子越大表示相关性绝对值越大,反之则越小。 3.3 显著性值 可切换标签类型为:星号(表示显著性值)+R值(表示相关性值),星号,无三种不同状态。
四、网络图部分功能介绍 …… 4.1 添加node节点 默认一个节点,需要展示多个关联节点与环境因子关联关系时,可通过" + "新增节点。 4.2 连线设置 线条粗细表示相关性的强弱,连线越粗表示相关性越强,反之越弱。
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