2022-11-09
微生物类群是否存在特定的模块单元以完成特定的生态功能?
是否存在关键物种其变化足以改变整个群落的组成变化?
不同的环境因子是否导致了该群落物种组成的差异?
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云朵朵这次给大家带来的是关系图工具介绍的合集(分为上下两篇),本篇主要介绍关联网络分析和网络热图,功能全,样式多,一起来看看吧~
一、关联网络分析
关联网络分析,用于显示各元素之间的互作关系。
1.1 准备数据文件+分组文件
● 第一列是物种名称,其他列为物种在样品中的丰度值。
● 分组文件第一列是样品名称(与数据文件的第一行样本名称互相对应),第二列是分组名称。
1.2 P显著性和Q显著性
可以根据P值和Q值进行过滤,当P值、Q值小于设置的显著性水平值则认为是显著的。
1.3 注释方式
图表的注释方式可分为按模块和按分组。
二、网络热图
网络热图是热图和网络图组成的,用来展示组内及组间的关联关系。
2.1 准备数据文件+因子文件
● 网络热图需要提供丰度数据文件和因子文件。(丰度)数据文件至少为两列,第一列为样本名,其它列为丰度数据。
● 因子文件至少为三列,第一列为样本名,其它列为因子数据。
2.2 添加关联节点
默认展示一个关联节点,当需要展示多个关联节点的数据矩阵与环境因子的关联关系时,可通过" + "新增节点。
2.3 显著性的类型
可切换标签类型为:星号(表示显著性值)+R值(表示相关性值),星号,无三种不同形式。
2.4 热图位置
支持调整热图位置为左上角或右下角。